Это типично для Линнея; он всегда был внимателен к достопримечательностям, звукам и ароматам природы и никогда не признавал различий между ботаникой и поэзией. Он провел свой отряд через 1440 миль Лапландии, через сотни опасностей и трудностей, и 10 сентября благополучно вернул их в Упсалу.
По-прежнему почти без гроша в кармане, он пытался прокормить себя чтением лекций, но один из конкурентов запретил ему читать лекции на том основании, что Линней еще не закончил медицинский курс и не получил степень. Тем временем Карл влюбился в «Лизу» — Сару Элизабет Мореа, дочь местного врача. Она предложила ему свои сбережения, он добавил свои и, получив деньги, отправился в Голландию (1735). В университете Хардервейка он сдал экзамены и получил диплом врача. Через год, в Лейдене, он встретил великого Бурхааве и почти забыл Лизу. Вдохновленный и получивший помощь от этого ученого вельможи, Линней выпустил одну из классических работ по ботанике — «Systema Naturae». За свою жизнь она выдержала двенадцать изданий; первое состояло всего из четырнадцати листов фолианта, двенадцатое — из 2300 страниц, в трех томах октаво. Недалеко от Амстердама он пополнил свои фонды, реорганизовав и каталогизировав ботаническую коллекцию Джорджа Клиффорта, директора Ост-Индской компании. С невероятным усердием он выпустил в 1736 году Bibilotheca botanica, а в 1737 году Genera Plantarum. В 1738 году он отправился в Париж, чтобы изучить Королевский сад. Там, не представившись, он присоединился к группе студентов, которым Бернар де Жюссье читал на латыни лекции об экзотических растениях. Одно растение озадачило профессора; Линней рискнул предположить: «Haec planta faciem americanam habet» (У этого растения американская внешность). Жюссье посмотрел на него и догадался: «Вы — Линней». Карл признался, и Жюссье, со всей ученой братией, оказал ему неослабный прием. Линнею предлагали профессорские должности в Париже, Лейдене и Геттингене, но он решил, что пора возвращаться в Лизу (1739). Такие долгие помолвки не были в то время чем-то необычным, и во многих случаях они, вероятно, способствовали стабильности нравов и зрелости характера. Они поженились, и Карл устроился врачом в Стокгольме.
Некоторое время, как и любой молодой врач, он тщетно ждал пациентов. Однажды в таверне он услышал, как один юноша жаловался, что никто не может вылечить его от гонореи. Линней вылечил его, и вскоре другие юноши, которым не терпелось доказать свою мужественность, пришли за аналогичным облегчением. Практика доктора распространилась и на легочные заболевания. Граф Карл Густав Тессин, спикер Палаты знати в Риксдаге, познакомился с ним и добился его назначения врачом Адмиралтейства (1739). В том же году Линней помог основать Королевскую академию наук и стал ее первым президентом. Осенью 1741 года он был избран профессором анатомии в Упсале; вскоре он сменил эту кафедру на кафедру ботаники, медицинской медицины и «естественной истории» (геологии и биологии); наконец-то он стал нужным человеком в нужном месте. Он передавал свой энтузиазм в отношении ботаники своим студентам; он работал с ними в неформальной близости, и никогда не был так счастлив, как когда вел их в какую-нибудь естественно-историческую вылазку.
Мы часто совершали экскурсии в поисках растений, насекомых и птиц. В среду и субботу каждой недели мы занимались траволечением с рассвета до темноты. Затем ученики возвращались в город в цветах на шляпах и провожали своего профессора в его сад под аккомпанемент деревенских музыкантов. Это была последняя степень великолепия в нашей приятной науке.
Он отправил нескольких своих студентов в разные уголки мира за экзотическими растениями; для этих молодых исследователей (некоторые из которых пожертвовали жизнью в своих поисках) он обеспечил бесплатный проезд на кораблях голландской Ост-Индской компании. Он стимулировал их надеждой внести их имена в большую систему номенклатуры, которую он готовил. Они отметили, что он дал название камелия цветущему кустарнику, который был найден на Филиппинах иезуитом Джорджем Камелем.
