— 21 июня 1941 года в десятом часу вечера в Кремль, к И.В. Сталину, — вспоминал В.П. Пронин, — были приглашены первый секретарь МГК партии А.С. Щербаков и я. Никаких пояснений «зачем» нам не дали. Когда мы зашли в кабинет, И.В. Сталин поднялся, вышел из-за стола нам навстречу. Поздоровавшись и пригласив за небольшой стол, без вступительных слов спокойно сказал: «По данным разведки и перебежчиков, немецкие войска намереваются сегодня ночью напасть на наши границы. Видимо, начинается война». Затем он обратился к нам с вопросами о состоянии противовоздушной обороны Москвы, подробно интересовался, все ли сделано для того, чтобы в непредвиденных обстоятельствах Москва могла достойно встретить врага, о настроениях москвичей. Беседа закончилась около трех часов ночи 22 июня. Во время ее несколько раз из Наркомата обороны, Киева, Белорусского военного округа звонили. Докладывали о том, что на границах спокойно. В конце беседы И. В. Сталин попросил нас (день был субботний) задержать до утра в городе руководителей партийных и советских органов. Распрощавшись, мы выехали в свои резиденции. У дома, где размещался МГК партии, нас встретил посыльный и сообщил, что, по данным ЦК ВКП(б), началась война с фашистской Германией. Приказывалось всем руководителям партийных организаций быть на месте…
В пятом часу утра в Моссовете состоялось совещание руководителей управлений и отделов Исполкома, председателей райсоветов и начальников служб МПВО. На нем были намечены меры по перестройке работы в соответствии с военной обстановкой, в частности, определены первые шаги по приведению всех служб МПВО в боевую готовность и переводу ряда предприятий на выполнение оборонных заданий, строительство убежищ и щелей, уточнены правила поведения населения во время налетов вражеской авиации.
Моссовет стал оперативно перестраивать свою систему управления. 23 июня на совещании руководящих работников Исполкома Моссовета, руководителей ведущих предприятий местной промышленности и промкооперации, рассказывал В.П. Пронин, обсуждался вопрос об организационной перестройке работы всех звеньев Исполкома и подчиненных ему предприятий и учреждений. Требовалось в течение двух дней представить конкретные предложения. 25 июня Исполком рассмотрел и утвердил предложения об упрощении структуры и сокращении штатов ряда управлений; 9 июля принял решение о сокращении расходов на административно-хозяйственный аппарат в городе, о слиянии ряда управлений и служб. Подобные решения Исполкома были приняты 1, 2 и 14 июля, 2 и 27 августа, 2 и 13 сентября, 22 ноября и др. По принятым решениям создавались новые административные единицы, становившиеся более оперативными в выполнении стоявших задач, они приносили и значительную экономию. Например, штаты Управления планировки были сокращены на 42 человека, отделы районных архитекторов упразднялись, а их функции возлагались непосредственно на архитекторов. Это дало ежемесячную экономию 327 334 рубля.
Перестройка коснулась и изменения стиля работы Исполкома, его управлений и отделов. Если в мирное время большинство вопросов обсуждалось на сессиях Моссовета или заседаниях Исполкома, то в условиях войны такая возможность не всегда представлялась. Требовалось решать их оперативно, особенно те, что связаны с выполнением военных заказов, а собрать даже членов Исполкома, не говоря о депутатах, большинство из которых являлись рабочими, не было возможности. Военная обстановка не допускала медлительности в решении неотложных вопросов. Поэтому по предложению В.П. Пронина Исполком принял решение о сужении коллегиальности в решении срочных вопросов и 25 июня утвердил новое распределение обязанностей между председателем Исполкома и его заместителями. Предоставлялось право каждому самостоятельно решать неотложные вопросы и давать распоряжения от имени Исполкома. Для контроля за выполнением как решений Исполкома, так и распоряжений председателя и его заместителей в Общем отделе была создана специальная группа контроля, которую возглавил заместитель председателя Исполкома А.В. Астафьев.
Распределение обязанностей выглядело примерно так: В.П. Пронин отвечал за организацию военного производства на предприятиях, подчиненных Моссовету, за эвакуацию предприятий и населения; Г.А. Силиванов — за работу местной промышленности, производство предметов бытового назначения, легкую промышленность и производство боеприпасов; Д.Д. Королев — за работу городского транспорта, доставку в город топлива и продовольствия; М.А. Яснов — за своевременное восстановление разрушенных вражеской авиацией зданий; П.В. Майоров — за организацию строительства и содержание укрытий для населения; И.Я. Фадин — за обеспечение населения продовольственными товарами; М.Г. Смирнова занималась эвакуацией, размещением детей и детских учреждений в безопасных районах страны.