В 40-х годах последователей Менно с легкой руки фрисландской графини Анны стали называть меннистами, что затем это название трансформировалось в меннонитов. В то же время широко распространившееся учение уже вызывало тревогу у властей. Анабаптисты отказывались служить в армии, приносить присягу в суде, обособляли себя от общества. Это привело к жестоким преследованиям сектантов. За голову Менно император Карл V назначил награду в 100 гульденов. Значительная часть первого поколения меннонитов была уничтожена.
Во времена гонений среди меннонитов оказалось много «падших», отрекшихся от своего вероисповедания. В церкви возник спор об отношении к таким «изменникам», что и привело к расколу. Радикалы во главе с Филиппом Дирком требовали отлучения всех предателей, умеренные (среди которых был и сам Симонс Менно) не были столь категоричны. В связи с этим меннонитский собор, на котором преимущество было у Дирка, осудил и предал анафеме всех умеренных. Последние образовали партию «либеральных тауфгезинтов». Впоследствии либералов стали называть грубыми меннонитами, радикалов — утонченными. Вскоре после раскола Менно перешел на сторону утонченных и проклял своих бывших союзников по лагерю.
Лидер меннонитов, похоже, вообще потерял в конце жизни конроль за ситуацией в собственной секте. Постоянные гонения и внутренние распри смутили проповедника. Говорят, что перед смертью (в 1561 г.) Менно сказал своим последователям: «Не будьте слугами людей, как я».
К основным канонам меннонитского вероучения, которые были окончательно утверждены на Дартской конференции в 1632 г., относятся, кроме общепротестантских принципов спасения и всеобщего священства, покаяние в грехах, сознательное крещение по вере, хлебопреломление, омовение ног, церковное отлучение, отказ от воинской службы.
Церковь меннонитов строилась на принципах братства, а жизнь христианина они понимали как прямое следование Христу и его учению; они отрицали любые войны и применение насилия; утверждали принципы любви и непротивления злу насилием и стремились к практической святости в жизни.
Главенствующими взглядами меннонитов являются представление об индивидуальной вере как исключительном средстве спасения и почитание Библии как единственного источника вероучения.
Согласно воззрениям меннонитов, Откровение, данное Богом, находится только в Библии, именно поэтому все остальное не может служить источником веры. Из всех текстов Библии основной упор делается на Новый Завет. Проповедники толкуют отдельные места Священного Писания, стремятся доказать, что все в мире предопределено божественными библейскими положениями и только они могут служить основанием человеческого опыта.
Существует двойственное представление о мире. Он, по их представлениям, состоит из мира духовного, вечного (где обитают сверхъестественные силы) и мира земного, материального, преходящего (где идет недолгая жизнь человека). В центре этого двойственного мира находится человек. Он является венцом божественного творения и тоже состоит из двух противоположных начал: духовного (бессмертного) и физического (смертного). Душа есть источник высших человеческих помыслов, которые направлены служению Богу, плотское тянет к мирской, низменной жизни. Человек должен сосредоточиться на внутренней, духовной жизни, которая приблизит его к Богу и к небесному блаженству.
У человека есть немного самостоятельности, хотя он и находится в зависимости от Бога. Он может избрать два пути — свой или божественный. Человек своей деятельностью может доказать, что он предопределен Богом к спасению. Это он может сделать через слово Божье, через безоговорочную и абсолютную веру в то, что Христос искупил своей смертью грехи всех людей.
Меннониты признают крещение взрослых людей, осознавших свое греховное состояние и вставших на путь истинный.
Вера в искупительную силу Христа и в его воскресение — это основной принцип всего христианского комплекса. Но в христианском учении важна Троица, а у протестантов главное место отводится Иисусу Христу. Он своим воскрешением из мертвых обновил природу человека, поврежденную грехом Адама и Евы. Во всех проповедях славится Христос, говорится о его деяниях и содеянных им чудесах. Много места занимает Иисус в духовных песнях и стихах. Очень много говорится о втором пришествии Христа, Страшном суде и конце мира. Когда придет Иисус, то воскреснут все мертвые для Страшного суда. Праведные, к которым меннониты относят всех своих приверженцев, воскреснут для вечной жизни в раю, а нечестивые — для вечных мучений в аду.
Вера в ад и рай является неотъемлемой частью религиозных воззрений меннонитов. Кроме того, существуют много рассказов о кознях дьявола и бесов, которые вселяются в людей и животных.
