В повседневной жизни меннониты придерживались строгих правил поведения — не пьянствовали, носили старомодную одежду. Женщина меннонитка находилась в безусловно подчиненном положении, ее жизнь ограничивалась четырьмя «К» —
В церковном отношении каждая община существовала независимо от других: она сама избирала своих духовных наставников и проповедников. Во главе каждой общины стоял «духовный старшина». Он проповедовал, совершал крещение (естественно, взрослых), хлебопреломление и утверждал проповедников и диаконов, председательствовал на общих собраниях, заботился о церковной дисциплине.
В 1851 г. был создан меннонитский церковный конвент для решения межобщинных дел.
К этому времени среди сектантов накопилось немало противоречий. В первую очередь, они были связаны с экономическими причинами. Постепенно увеличилось число малоземельных и безземельных меннонитов. Они-то и выступили в начале 60-х годов XIX века за обновление религиозной нравственности, возвращение к идеалам ранних меннонитских общин.
Отошедшие от официального конвента сектанты стали называться новоменнонитами. У новоменнонитов нравственные требования выполнялись гораздо строже. Именно эти представители протестантской церкви заселили земли на Кубани, Тереке и на Кавказе. (Правительство таким образом пыталось решить проблему дефицита земли у меннонитов.) В 1872 г. на конференции в с. Андреасфельд был оформлен Союз новоменнонитского братства.
В 1874 г. в Российской империи была начата военная реформа. Одним из главных ее положений было введение всеобщей воинской повинности. Это послужило толчком для начала эмиграции меннонитов из России в США и Латинскую Америку. Сектантам, оставшимся в России, было предложено проходить альтернативную службу. Так, многие меннониты в мирное время трудились в пожарных командах, лесничествах, в ремонтных верфях. Меннонитские общины обеспечивали их содержание во время прохождения службы. На войне меннониты работали в санитарных частях. (Например, были меннониты-санитары и в армии Колчака.)
К началу XX века в России насчитывалось около 100 тысяч меннонитов, колонии которых владели миллионом десятин высокопродуктивных сельскохозяйственных угодий. Благодаря значительным налоговым льготам, успешному ведению хозяйства, традиционной экономии сектанты скопили в своих руках значительные капиталы.
Во времена Советской власти меннониты подверглись репрессиям. В 1963 г. братские меннониты официально объединились с баптистами, была создана единая организация во главе со Всесоюзным Советом евангельских христиан-баптистов (ВСЕХБ). Ввиду массовой эмиграции немецкого населения в конце 80-х — начале 90-х годов прошлого века количество общин серьезно сократилось. В 2003 г. в России была зарегистрирована одна меннонитская организация.
В Америку последователи Менно стали прибывать во второй половине XVII века. В 1700 г. они поселились в протестантском штате Пенсильвания, основанном квакером У. Пенном. Для своих поселений голландские и немецкие протестанты меннонитского толка выбирали обычно «текущую» западную границу страны. Так, в начале XIX века меннониты из Швейцарии и южной Германии поселились в Огайо. После гражданской войны в США начали прибывать сектанты из России, которые основали колонии в Канзасе, Небраске и Южной Дакоте. Во время Первой мировой войны меннонитские колонии появились в Канаде. После Второй мировой войны протестантские иммигранты из немцев облюбовали Мексику, Бразилию и Парагвай. В Новом Свете, так же, как и в Старом, меннониты занимались, в первую очередь, фермерством.
Меннониты в США представляют несколько разных организаций: Старую Меннонитсвую церковь, которая продолжает традиции Пенсильванских сектантов; Меннонитскую церковь Генеральной конференции (организованную в 1860 г. в Айове); Меннонитскую братскую церковь.
Существует и Амишеская ветвь секты, названная так в честь швейцарского епископа Аммана, жившего на рубеже XVII и XVIII веков. Амиши и сейчас поражают туристов крестьянскими костюмами образца трехсотлетней давности, повозками, как будто взятыми из фильмов о первых переселенцах. Они не пользуются электричеством, автомобилями, говорят на устаревшем наречии голландских колонистов.
Однако у большинства меннонитов религиозно-нравственные правила претерпели некоторые изменения. Сейчас они пытаются принимать активное участие в общественной деятельности, входят в ряд Всемирных церковных организаций. Меннониты основали ряд учебных заведений, издают свои газеты и журналы, поддерживают интернет-сайты.