Ещё до подхода отряда И.С. Поскочина на острове Кефаллония восстали местные жители. Для этого были достаточные исторические предпосылки. Во время Первой экспедиции русского флота в Архипелаг на стороне русских действовал корпус кефаллинистов численностью до 3 тысяч человек. Корпус был организован семейством графов Метаксов. Из этого рода был и Е.П. Метакса. В составе русского флота многие офицеры по происхождению были кефаллонистами. После службы часть из них возвращалась на родину и теперь составляла «русскую партию». «Считалось, что на острове к 1798 году находилось до тридцати отставных офицеров русской службы» (Станиславская, с. 110).
13 октября жители города Аргостолиона разоружили местный французский гарнизон. Небольшие два русских отряда (около 10 человек каждый) высадились на остров. Через два дня (15 октября) десантные отряды и вооруженные отряды жителей под командованием русских заняли очередной город Ликсури, затем крепость Сталамье, расположенный вблизи города Кефаллонии. Противник заперся в крепости Ассы. Эта крепость имела 25 пушек, однако была взята 17 октября. Далее требовалось переловить всех французов, скрывавшихся в горах и ущельях, что и было сделано с помощью жителей. В плен на острове было взято 197 солдат и 11 офицеров.
К тому времени весь десант, высаженный на остров под командованием лейтенанта Литвинова составлял до 180 человек. И как отмечается в (Скаловский), он был необходим не столько для овладения крепостями, сколько для охранения городских жителей от поселян, которые под предлогом мщения и наказания якобинцев, хотели разорить и разграбить дома богатых дворян. 17 октября на берег сошло русско-турецкое командование отряда. Оно было торжественно встречено и, в свою очередь, призвало жителей к успокоению.
Ф.Ф. Ушаков и Кадыр-бей с основными силами эскадр прибыли к острову 23 октября. На них тут же «свалилась» политическая проблема – примирить тех, кто восстал и тех, кто до этого поддерживал французов (якобинцев). Решена она была путем амнистии якобинцев, а также избрания в органы местного самоуправления представителей всех слоев населения. На рейде острова Ф.Ф. Ушаков находился до 29 октября, пока не получил сообщение Д.Н. Сенявина о затруднениях в овладении островом Св. Мавра.
Остров Св. Мавры (Лефкас или Левкад) расположен вблизи албанского берега и отделяется от него искусственным каналом шириной около 300 метров прорытым в древности либо коринфянами либо карфагенянами. Канал очень мелкий, а иногда вовсе пересыхающий. Поэтому к освобождению острова с суши ещё до подхода Сенявина готовился местный турецкий правитель Янинский Али паша Тепеделинг (далее Али паша). Местность на острове гористая. Крепость располагалась на крутой горе и оборонялась гарнизоном в 550 человек. Она с двух сторон была окружена морем, а с других двух сторон – широкими и глубокими рвами наполненными водой.
Отряд Д.Н. Сенявина прибыл к острову 21 октября. И на этом острове восставшее местное население уже контролировало всю территорию за исключением крепости. Оно желало, чтобы островом овладели русские, а не Али паша. Паша без видимого сопротивления отказался от своих первоначальных намерений и обещал помощь эскадрам войсками и судами.
Сенявин в первый же день начал блокаду острова, а также высадил на берег 383 «морских солдата» и матроса с 6 полевыми орудиями под командованием капитан-лейтенанта графа Н.Д. Войновича. На следующий день было высажено ещё 104 матроса и командира с пушками, а также приняты в своё подчинение 130 (всего лишь, в отличие от тысяч на других островах) местных жителей. Десантные войска к 23 октября оборудовали три 8-пушечные батареи. Через четыре дня турками была оборудована ещё одна батарея (4-пушечная) на албанском берегу. Для этого на берег было высажено 180 турок и 15 русских канониров.
Артиллерийский обстрел крепости в течение нескольких дней привел к тому, что французский гарнизон выдвинул определенные условия сдачи, которые, однако, не соответствовали заранее обозначенным требованиям Ф.Ф. Ушакова и Кадыр-бея. В данной ситуации Д.Н. Сенявин решил об этом сообщить Ф.Ф. Ушакову и тот, отправив на усиление блокады Корфу корабль «Св. Троица», два турецких фрегата и корвет, с остальными силами прибыл к о. Св. Мавры 31 октября. В тот же день были осмотрены батареи, разосланы публикации с приглашением жителей к штурму крепости. Противнику послано письмо с обещанием «…не давать никакой пощады, если крепость будет взята штурмом». Такое условие было обычным для тех времен и неоднократно реализовывалось ранее (штурм Очакова, Измаила и др.). Достаточно вспомнить лаконичный ультиматум А.В. Суворова перед штурмом Измаила (см. выше).