В то время, когда осуществлялось развертывание эскадр, в Черном море готовились к выполнению поставленных задач эскадра кораблей под командованием контр-адмирала П.В. Пустошкина для усиления эскадры в Средиземном море и, так называемая, резервная эскадра под командованием контр-адмирала И.Т. Овцына для крейсерства в Черном море и возможного дальнейшего усиления сил в Средиземном море. Как раз в день, когда Ушаков отдал ордер на занятие первого острова (24 сентября) эскадра И.Т. Овцына в составе двух устаревших 46-пушечных фрегатов («Царь Константин» и «Фёдор Стратилат»), одного 32- пушечного фрегата («Иоанн Златоуст») и 16-пушечного аката № 2, приступила к крейсерству.
7 октября Пустошкин вышел из Херсона к Ахтиару, чтобы соединиться с кораблем «Симеон и Анна». Вскоре он был застигнут жестоким штормом. Во время шторма наблюдал крушение кораблей эскадры И.Т. Овцына. Корабли резервной эскадры волной и ветром выбросило на берег Анкермана. Погибло около 600 человек, в том числе и контр-адмирал И.Т. Овцын. Резервная эскадра, по существу, прекратила своё существование. Понесенные потери, по каким-то причинам не учитываются в потерях средиземноморских кампаний, хотя все корабли действовали по единому замыслу.
Таким образом, в Средиземное море, по-существу, были отправлены все боеспособные корабельные силы Черноморских флотов. Берега Крыма и в районе Одессы (Гаджибей переименован в Одессу 10 января 1795 года) оказались без защиты с моря. Если предположить, что их не требовалось защищать, поскольку Порта стала союзником, то зачем нужно было отправлять в крейсерство резервную эскадру? Насколько известно, историки пока не поставили данного вопроса и не анализировали его.
П.В. Пустошкин со своей эскадрой, загрузив необходимые запасы, в том числе и для снабжения кораблей из эскадры Ушакова, вышел из Ахтиара 26 октября. На Корфу эскадра прибыла 30 декабря, в то время, когда Ушаков и Кадыр-бей блокировали остров и готовились к штурму крепостей. На развертывание эскадры Пустошкина ушло 64 суток, несколько больше, чем эскадры Ушакова.
На формирование и развертывание соединённых эскадр потребовалось почти полтора месяца (13 августа – 24 сентября). По темпам жизни восемнадцатого века это было спешное развертывание, с неразрешенными политическими и военными вопросами. Не был предварительно урегулирован вопрос прохода эскадры через Босфор, не определена военная цель предстоящих действий, даже приблизительно не обозначены сроки нахождения эскадры в Средиземном море, не установлен порядок снабжения и ремонта кораблей. Наконец, не был заключен союзный договор между Россией и Блистательной Оттоманской Портой. В силу указанных обстоятельств, уже в ходе развертывания сил, пришлось в условиях политической неопределенности в Константинополе формулировать конкретную главную военную цель действий – освобождение Ионических островов и защита турецких и албанских берегов от десантов со стороны Анконы. Обозначился совершенно иной, чем ожидалось ранее, характер предстоящих действий. Выяснилось, что предстоит главным образом, не морские бои, а десантные действия по освобождению островов. Однако для таких действий эскадры в своем составе имели совершенно недостаточное количество войск и малых судов. Т. е. состав соединённых эскадр не в полной мере соответствовал предстоящим действиям. Пришлось принимать дополнительные меры об усилении корабельного состава и по поиску десантных войск. На первом же этапе в русской эскадре около 50 % кораблей получили повреждения и во всей полноте была осознана важность проблемы ремонта и снабжения. Подводя итог анализу действий русской эскадры на этапе развертывания, можно резюмировать – в очередной раз в истории, политики в своих решениях были недостаточно конкретны, не учитывали ряда военных факторов. Они действовали явно по принципу: «Требуется ввязаться в бой – вяжемся в бой, а там разберемся». Вице-адмирал Ф.Ф. Ушаков проявил традиционные качества русских военных – не подвергать сомнениям любое политическое решение и выполнять его, преодолевая любые возможные трудности.
Ионические острова – Корфу или Керкира, Закинф (в итальянском варианте – Занте), Кефаллиния (Кефаллония), Лефкас или Левкада (о. Св. Мавры), Итака, Паксос (Паксо), Китира (Цериго), во внешней политике России длительное время (до восстановления независимости Греции), как отмечалось, играли видную роль. Население Ионических островов в конце XVIII века составляло 200–250 тысяч человек. Основой экономики на островах было садоводство, виноградарство; главными культурами – оливковое дерево и виноградная лоза. На некоторых островах работали мануфактуры.