На протяжение столетий маленькая аграрная страна, на территории которой находится современная Эстония, была одной из самых малонаселенных стран Европы, что обусловило ее миролюбивый характер. Это нашло свое отражение в том числе и в специфике раннего эстонского судопроизводства, для которого были характерны широкое распространение разрешения споров мирным путем и мягкость применяемых наказаний. Традиции консенсуса и неуклонное соблюдение этих традиций настолько глубоко укоренились в средневековой Эстляндии, что когда в начале XIII века страна подверглась нашествию сначала крестоносцев, а затем датчан, эсты сделали так, что завоеватели вынуждены были соблюдать местные обычаи и правила, в том числе касающиеся прав землепользования. Последующее пребывание под германским и шведским владычеством оставило свой след в эстонской правовой системе и системе правосудия, в которой угадываются как черты древнего национального права, так и значительное влияние римского права. В XVIII веке, после окончания Северной войны и капитуляции Швеции, эстонские земли (Эстлян-дия и Лифляндия) были присоединены к Российской империи, в составе которой пребывали до 1917 года. 28 ноября 1917 года Временный национальный совет провозгласил себя высшим органом государственной власти в стране, но немецкая оккупация и российская революция затянули начало процесса формирования национальной эстонской судебной системы до конца 1918 года. В 1919 году был создан Национальный Суд, ставший высшим судебным органом Эстонии, вслед за ним была учреждена система административной юстиции. Принятый в 1938 году Акт о судах ознаменовал завершение формирования национальной судебной системы. К этому моменту в Эстонии уже были приняты Уголовный и Гражданский кодексы и соответствующее процессуальное законодательство.
Насильственное включение Эстонии в состав Советского Союза означало не только утрату суверенитета, но и крах национальной судебной системы. Национальный Суд был ликвидирован, Апелляционный Суд
После начала процесса восстановления независимости Эстонии первым наиболее важным актом, имевшим непосредственное отношение к судебной системе страны, стала Декларация о суверенитете от 16 ноября 1988 года, провозгласившая суверенитет Эстонской ССР и означавший, что высшая власть на территории страны принадлежит законодательным, исполнительным и судебным органам государственной власти. 30 марта 1990 года Верховный Совет Эстонской ССР в постановлении «О государственном статусе Эстонии» провозгласил желание населения восстановить независимость страны и признал государственную власть СССР в Эстонии незаконной с момента установления. В своем постановлении от 16 мая 1990 года Верховный Совет Эстонии провозгласил, что судебная система Эстонской Республики должна быть создана в соответствии с пожеланиями народа и общепризнанными нормами международного права.
В 1991 году были приняты законы Эстонской Республики «Об адвокатуре Эстонии», «О судах», «О статусе судьи», «Об Арбитражном суде Торгово-промышленной палаты Эстонии», а также внесены изменения в действующий закон «О полиции». В 1992 году был принят новый Уголовный кодекс Эстонии и внесены изменения в УПК.
Основы судебной системы Эстонии определены в главе 13 Конституции 1992 года, законе о судах и законе о статусе судьи. Судами первой инстанции являются уездные суды и городские суды, рассматривающие гражданские и уголовные дела, а также административные суды. Окружные суды являются судами второй инстанции. Они рассматривают в апелляционном порядке решения и постановления уездных, городских и административных судов и делятся на коллегии в соответствии с категориями рассматриваемых дел. решения по которым принимаются коллегиально. Верховный Суд Эстонии является высшей судебной инстанцией страны, облеченной полномочиями пересматривать решения нижестоящих судов в кассационном порядке и осуществлять функции конституционного контроля. Организационная структура Верховного Суда включает в себя Палату по гражданским делам, Палату по уголовным делам, Палату по административным делам и Палату конституционного контроля, а также Пленум (Генеральную Ассамблею) Верховного Суда Эстонии, в состав которого входят все судьи ВС.
