1 октября АКОфлот имел 13 судов общей грузоподъемностью 36 070 т, в том числе 12 сухогрузов и один танкер. Три сухогруза, вмещавшие 5 350 т, были получены в этом году.
За 1938 — 1939 хозяйственный год перевезено 73 500 т и 8 100 чел. (54,8 и 77,1 % плана соответственно). Стоимость имущества АКОфлота составила 113,6 млн руб.
1940
1 января АКОфлот включал: сухогрузные пароходы «Ительмен», «Колыма», «Орочон», «Сима», «Чавыча», «Якут», «Эскимос», «Щорс», «Чапаев», «Петропавловск», «Коккинаки», «Терней»; танкер-теплоход «Максим Горький». К перевозкам людей и грузов привлекались паровые траулеры «Гага», «Палтус», «Топорок», «Лебедь», «Буревестник», «Дальневосточник», «Восток».
29 января «за проявленную инициативу и большую энергию по проведению капитального ремонта собственными силами судов АКО» 12 сотрудников АКОфлота были награждены знаком «Отличник рыбной промышленности».
3 февраля НКРП СССР распорядился передать «Петропавловск» и «Колыму» Северо-Приморскому госрыбтресту. Передача «Петропавловска» прошла во Владивостоке в мае, «Колымы» — в ноябре.
Февраль. Во Владивостоке открылось Морское агентство АКОфлота (ликвидировано 14 октября по приказу НКРП СССР).
Сентябрь. Ликвидирован институт помполитов на судах флота рыбной промышленности.
1 октября при секторе кадров управления АКО открылись курсы машинистов, кочегаров и матросов 1-го класса общей численностью 120 чел.
17 октября началась приемка грузопассажирского судна «Анатолий Серов» дедвейтом 5 700 т, скоростью хода 9 узлов, имевшего 26 каютных пассажирских мест, построенного в 1926 г. в Англии. Летом 1938 г. его приобрел НКРП СССР.
При плане 160 000 т и 8 500 пассажиров флот АКО перевез 112 339,6 т и 11 846 чел. Выполнение плана составило 73,7 %. В 1939 — 1940 хозяйственном году общая грузоподъемность судов флота составляла 35 585 т. За год он выполнил 63 рейса с грузом и семь в балласте. В среднем одно плавание длилось 43,5 суток.
1941
Январь. АКОфлот включал пароходы «Чавыча», «Сима», «Анатолий Серов», «Эскимос», «Якут», «Чапаев», «Щорс», «Орочон», «Ительмен», «Терней», «Коккинаки» и танкер-теплоход «Максим Горький».
Предприятие обзавелось подсобным сельскохозяйственным производством, расположенным на 20-м километре Елизовского шоссе.
6 июня в Портленде (США) завершил ремонт пароход «Орочон».
22 июня началась Великая Отечественная война.
26 июля ремонт в США прошел «Эскимос», 6 августа — «Якут».
Сентябрь. Восстановлен упраздненный год назад институт судовых помполитов.
6 ноября постановлением СНК СССР и ЦК ВКП (б) морской транспортный флот военизирован. В АКО создан Отдел боевой подготовки.
30 ноября НКРП СССР распорядился воссоздать политорганы в военизированных подразделениях флота рыбной промышленности. Вновь восстанавливался политотдел АКО.
За год перевезено 129 700 т и 9 800 пассажиров.
1942
24 января организован дивизион «особой транспортной службы» (АКОфлот), командир — начальник флота Я. М. Драбкин.
17 февраля начальник АКО подписал приказ «О прохождении военно-морской подготовки личным составом дивизионов флота АКО».
3 апреля начал действовать утвержденный командиром Петропавловской военно-морской базы календарный план военной подготовки дивизионов флота АКО.
29 мая на суда распространены действия Устава о дисциплине рабочих и служащих Морского флота Союза ССР, утвержденного постановлением СНК СССР и ЦК ВКП (б) № 1085 от 22 июня 1940 г., и Устава службы на судах Морского флота Союза ССР, утвержденного НКМФ СССР 5 августа 1941 г.
Сентябрь. Из Петропавловска в Портленд на ремонт вышел пароход «Орочон».
23 ноября танкер «Максим Горький» отправился в Сиэтл.
24 ноября из Петропавловска в Портленд отправился пароход «Щорс».
За год перевезено 164 847 т и 4 697 чел. Задание по грузам оказалось недовыполнено на 5 953 т или на 3,5 %, по пассажирам — перевыполнено на 18,1 %. Общий итог выполнения плана — 97,0 %. Хозяйственная деятельность предприятия признана удовлетворительной.
1943
1 января все суда переведены на полный хозрасчет с самостоятельным балансом и бухгалтерией. В порядке опыта у самых крупных судов открыты отдельные счета в госбанке. В действие введено «Положение о хозрасчетном морском транспортном судне Управления флота АКО».
Январь. В Сан-Франциско прибыл пароход «Чапаев».
16 марта вышел приказ № 07 по Управлению военизированного флота (УВФ) Камчатского бассейна (так стала называться организационная структура, руководившая первым и вторым дивизионами, то есть АКОфлотом и Морловом) об улучшении боевой подготовки на судах. Приказами по дивизионам на каждом судне из числа командного состава назначался помощник командира корабля (то есть капитана судна) по военной части.
7 апреля в США отправился пароход «Якут».
