Но годы идут, и прекрасной царице Нефертити, не сомневающейся в том, что "она (бок) о бок с Эхнатоном вековечно, как Небо остается вековечно с тем, кто в нем (т.е. с Солнцем)", тоже пришлось пережить муки ревности отвергнутой супруги. Так, на известняковом изваянии из той же мастерской Тутмоса Нефертити показана "какой-то измождённою, видимо, стареющею" (Ю.Я. Перепёлкин "Тайна золотого гроба". 1969). Судя по одному из изваяний Нефертити, "ее лицо с годами похудело, и кости на нем обозначились заметней, от носа к уголкам рта пролегли резкие складки, груди немного отвисли, осанка стала чуть-чуть сутулой", - возможно, она болела. Последние годы жизни, начиная с тринадцатого (Е.Ф. Кэмпбелл) года правления Эхнатона, Нефертити, мать шести дочерей (своей пятой дочери она дала имя "Нефер-неферу-Ра", а шестой - "Сетеп-эн-Ра" - "Избранница Ра"); которая так и не смогла родить мальчика (наследника), провела "в отдалении" от разлюбившего её мужа. Нефертити умерла своей смертью в возрасте ок. 30 лет ещё при жизни Эхнатона (приблизительно такую цифру, с учётом времени замены в надписях имени царицы "Нефертити" на имя её дочери царицы "Мери-та-Атон", дают простые подсчёты), и была погребена в Ахет-Атоне с почестями, как царица, как уважаемая мать детей фараона, благодарного её за годы счастья, но не как опальная изгнанница. Об этом свидетельствует надпись на её посмертной скульптуре: "Великой царице, заслужившей восхище-ние Эхнатона, супруге властелина, Нефертити. Пусть живёт вечно" (от Тутанхамона следовало бы ожи╛дать посмертной надписи иного содержания).
В 1922 г. раскопками в эль-Амарне руководил сер Леонард Вулли. На южной окраине города он обнаружил великолепную усадьбу с садами и прудами, с небольшими подсобными сооружениями. Вначале эта усадьба принадлежала Нефертити, однако, как выяснилось, в последние годы царствова-ния Эхнатона владелица усадьбы время от времени менялась: после Нефертити ею стала побочная (младшая) жена царя - "шапсе" (честная; почтенная) Кийе (Мери-Кийе, дочь хурритки Гилухены (Ги-лухепы), третьей жены Аменхотепа III), а после Мери-Кийе владелицей стала Мери-та-Атон, старшая дочь Нефертити.
По сведениям Л. Гарднера (91.с275), архивы указывают на то, что не безупречная Нефертити была вытеснена (было отдано предпочтение) "большой любимицей царя" Кией (самые ранние сведения о Кийе (Кие), как о "побочной" жене, восходят, примерно, к восьмому году правления Эхнатона), которая родила фараону сына или двух, а также дочь, и стала затем главной женой и царицей под именем Мери-Атон (изображения и надписи с именем "Кийе" были переделаны на "Мери-Атон").
Страстная и нежная натура Мери-Кийе вечно живет в ее молитве, обращенной к своему царственному возлюбленному (надгробная надпись в интерпретации Э.Х. Гардинера и Ю. Перепёл-кина): "Буду обонять я дыхание сладостное, выходящее из уст твоих. Буду видеть я красоту твою постоянно, мое желание. Буду слышать я голос твой сладостнее северного ветра. Будет молодеть плоть моя в жизни от любви твоей. Будешь давать ты мне руки твои с питанием твоим, буду принимать я его, живущий правдою. Будешь взывать ты во имя мое вековечно, не надо будет искать его. В устах твоих, мой владыка (...дитя доброго Йота живого, который... жив вечно), будешь ты со мною вековечно живым, как Йот (Атон)".
У Эхнатона, как и у Мери-Кийе, - красивой, со слегка жестоким выражением лица, были большие, слегка раскосые глаза, что вполне может указывать на примесь хурритской крови в жилах Эхнатона, внука митаннийки Мутемуйа (происходящей из того же царствующего дома, что и Гилухепа).
И настал день, когда молодая красавица "шапсе" воспарила почти столь же высоко, как и Нефер-тити, ещё так недавно столь любимая, "самая красивая из всех женщин", "величайшая любовница", которую Эхнатон называл "хозяйкой своего счастья". И постылую Нефертити, - быстро стареющую, много рожавшую восточную женщину, не отвечающую более запросам мужа, вожделевшего, чтобы "молода она (была) вековечно" и "тысячу тысяч лет была (бы) под рукой фараона", удалили "с глаз долой" (после кончины Макетатон).