В политическом отношении включение Алавы в Кастилию принесло с собой большие перемены. Бегетрия с выборным сеньором типа de mar а mar вскоре превращается в явно выраженную сеньорию; исчезает Братство Аррьягги, которое вместе с четырьмя прежними советниками и канцлером или верховным судьей, по-видимому, являлось основным органом управления до 1332 г. С 1200 г. (год завоевания Витории) появляются представители короля Кастилии — графы. Начиная с 1332 г. отчетливо намечается два вида власти — центральная и местная. Король управлял Алавой через своих уполномоченных — главного аделантадо Кастилии, алькальдов, мэринов, счетчиков и др. За королем, помимо прав высшей юрисдикции, признавались права фонсадеры (призыва жителей провинции в коронное войско). Королю выплачивались особые подати — семойо (semoyo) — налог в натуре с урожая пшеницы и ячменя и сбор «мартовского вола» (bueij del marzo) — натуральная подать на приплод рогатого скота.
Носителями начал местной автономии были генеральные хунты, состоявшие из представителей городов и сеньорий. Они собирались дважды в год: одна хунта созывалась в Витории в мае, а другая — в одном из соседних городов в ноябре. Это различие объяснялось разделением всего населения Алавы на две группы с особым государственным и частным правом для каждой из них: на городское население, проживавшее в ciudades и villas (городах), и сельское, которое концентрировалось в villas esparsas (селах). Городское население состояло из свободных граждан, а сельское — из крестьян, которые, не будучи уже крепостными, освободились от сеньоров далеко не полностью, поскольку экономические узы, связывающие их с последними, не были порваны. Эти генеральные хунты выбирали двух комиссаров и четырех депутатов, членов исполнительного комитета хунт, ведавшего общими для всей области внутренними делами. Для урегулирования деятельности хунт было дано несколько указов, из которых наиболее известны указы Хуана II от 1417 г. В этих указах определялись порядок выборов и регламент сессий и признавалась важнейшая привилегия хунт, так называемая «Судебная виза» (Pase forai), т е. право проверять королевские распоряжения (в особенности относящиеся к отправлению правосудия в Алаве) с целью определить, соответствуют ли они местным фуэрос.
Различные округа Алавы весьма разнились друг от друга по своему внутреннему устройству — в соответствии с тем, управлялись ли они сообразно своим фуэрос или были сеньориями. Но все они имели свои хунты, носившие различные наименования в зависимости от того, какую общность они представляли. Местные объединения следовали в таком порядке: поселения (pueblos) союзы или советы, образованные несколькими поселениями; эрмандады из нескольких советов и группы (cuadrillas) из нескольких эрмандад. Хунты этих групп собирались для решения экономических проблем, и именно они выбирали прокураторов или депутатов в генеральную хунту, причем процедура выборов бывала самой различной.
Для отправления правосудия в каждой эрмандаде имелись, помимо королевских судей и фискалов (прокуроров), алькальды. В 1417 г. был создан трибунал эрмандад Витории, Сальватьерры и Тревиньо, который должен был ежегодно избирать алькальдов по уголовным делам и двух комиссаров-инспекторов. У дворян были свои собственные алькальды, с особой юрисдикцией.
В области частного или гражданского права, а следовательно, и социальных институтов в Алаве наблюдается уже отмеченное нами различие между городским и сельским населением. В городах действовало кастильское право, с которым мы уже ознакомились. В сельских местностях (где существовало более 50 населенных пунктов) был порядок, сходный с бискайским, благодаря преобладанию норм обычного права.