Представленные в Комиссию наказы с мест формулировали разнообразные, зачастую противоречивые интересы сословий. Убедившись в отсутствии согласия и малой продуктивности Уложенной комиссии, императрица распустила ее 17 декабря 1768 г. под предлогом начала Русско-турецкой войны.
Уложенная комиссия хотя и не выполнила своей задачи, но дала императрице представление о чаяниях представителей различных сословий. С использованием материалов работы Комиссии в конечном итоге были подготовлены Учреждение для управления губерний и Жалованные грамоты дворянству и городам.
В царствование Екатерины II произошел ряд глубоких социальных потрясений, вызванных общими тяготами жизни податного населения, произволом местных властей и помещиков, национальной рознью. Крупнейшими из них стали чумной бунт в Москве 1771 г. и крестьянская война под руководством Е. Пугачева. Бунт 1771 г. был вызван эпидемией чумы, занесенной с театра военных действий русско-турецкой войны. Запрет московского архиепископа Амвросия на паломничество к иконе Божией Матери у Варварских ворот вызвал возмущение населения, а городские власти не справились с ситуацией. Архиепископ пытался скрыться, но был схвачен и растерзан толпой в Донском монастыре. На подавление бунта пришлось послать гвардейский полк из Санкт-Петербурга.
Значительно более опасным испытанием для государства стала крестьянская война под руководством Емельяна Пугачева 1773–1775 гг.
В августе 1773 г. в среде яицкого казачества появился Е. Пугачев, заявивший, что он – чудесно спасшийся от рук убийц царь Петр Федорович. В распространяемых им «манифестах» и «указах» Пугачев призывал оказать «законному императору» содействие в возвращении отнятой власти и не скупился на популистские обещания, рассчитанные главным образом на казачество. Выступления самозванца имели успех. Вокруг него начали группироваться сначала казаки, а потом все более широкие массы недовольных.
Емельян Пугачев, родился в станице Зимовейской на Дону. Отличался авантюризмом, талантом организатора, мужеством и жестокостью. Он прекрасно понимал, что если выступит под своим именем, то не сможет собрать сколько-нибудь мощное ополчение. Как и самозванцы XVII в., Пугачев использовал легитимистские чувства русского народа, благодаря которым даже явный бунт нуждался в оправдании служением якобы законному государю.
5 октября 1773 г. восставшие пытались взять штурмом губернский город Оренбург, но потерпели неудачу и начали осаду, длившуюся полгода. Пугачевцы разбили посланные на выручку защитникам Оренбурга правительственные отряды Кара и Чернышова.
Под Оренбургом вооруженные формирования восставших насчитывали уже около 30 тысяч человек. Это была настоящая повстанческая армия. В Бердской слободе обосновался сам «Петр III» и провозглашенная им «императрица» Устинья Кузнецова с «двором» и «коллегиями». Пугачев даже начал жаловать «придворные титулы» своим приближенным.
Разбитый повстанцами Кар отступил к Казани. Слухи о творимых пугачевцами жестокостях наводнили ужасом не только близлежащие территории, но и всю империю. Демонстрируя особое внимание к проблеме и солидарность с дворянами, подвергавшимися непосредственной угрозе, Екатерина объявила себя «казанской помещицей».
22 марта 1774 г. под Татищевой крепостью правительственные войска нанесли первое крупное поражение восставшим. Пугачев вынужденно снял осаду Оренбурга. Но его войско быстро пополнилось новыми силами. В период с апреля по июнь 1774 г. война вновь разгорелось на территории Поволжья, Урала и Башкирии, где Пугачев нашел союзника в лице предводителя башкир Салавата Юлая. 12 июня 1774 г. Пугачев появился под стенами Казани с 20-тысячным войском. Ему удалось захватить весь город, кроме кремля. Пришедший на помощь осажденным отряд полковника Михельсона разбил пугачевцев, и 17 июля они переправились на правый берег Волги.
Пытаясь расширить социальную базу восстания, Пугачев начал в своих манифестах обращаться и к крестьянам. В Манифесте от 31 июля 1774 г. лже-Петр «освободил» крестьян от крепостной зависимости и податей и призвал их «ловить, казнить и вешать» дворян.
Однако крестьянская война вступила уже в завершающую стадию. Пугачевцы захватывали города, разоряли их и быстро ретировались при приближении регулярных войск. Попытка повстанцев овладеть Царицыным не увенчалась успехом. Пугачев переправился на левый берег Волги. 12 сентября 1774 г. яицкие казаки, разочарованные в «императоре», схватили его и выдали Михельсону. 10 января 1775 г. Е. Пугачев и несколько его ближайших соратников были казнены на Болотной площади в Москве.
Крестьянская война под предводительством Пугачева окончилась поражением. Ей свойственны были стихийность, локальность движения, неоднородный социальный состав, отсутствие ясной программы и целей борьбы. Крестьянская война заставила Екатерину II провести серию реформ по централизации и унификации органов управления в центре и на местах и законодательному закреплению сословных прав населения.
