Упрощалась структура судов. Устанавливалось два их вида: мировые и общие (коронные). Мировой суд учреждался для разбора гражданских исков на сумму до 500 рублей и вершился судьей единолично. Более сложные дела поступали в окружные суды, являвшиеся первой судебной инстанцией в пределах губернии; в судебные палаты, которые объединяли несколько судебных округов и состояли из уголовного и гражданского департаментов. Решения окружных судов и судебных палат могли быть обжалованы в Сенат, который имел право отмены или пересмотра судебных решений. Органом судебного надзора становилась прокуратура.
Учреждались должности судебных следователей для предварительного расследования дел, вводился институт присяжных и частных поверенных (адвокатура). Решение о виновности привлеченного к суду выносили присяжные заседатели из представителей гражданского населения. Поскольку они выносили вердикт «по совести», суд присяжных являлся специфической формой выражения общественного мнения. Решение суда, таким образом, зависело от состава присяжных. Поэтому для них устанавливался высокий имущественный ценз, что практически исключало возможность участия в судебном процессе демократической части общества. Судебными уставами 1864 г. впервые вводилась практика нотариального сопровождения судебных актов и сделок.
Председателей и членов судебных палат и окружных судов утверждал император, а мировых судей – Сенат. По закону они не подлежали увольнению или временному отстранению от должности.
Таким образом, в судебной реформе в наиболее полном объеме были осуществлены принципы буржуазного права, хотя сохранялись черты и дореформенного суда. Например, существовали духовные и военные суды; на высших сановников не распространялась юрисдикция судебных округов и палат, а различные «дополнения» и «разъяснения», последовавшие во второй половине 60-х гг., поставили судебных чиновников фактически в зависимость от губернаторов. Закон 1872 г. ограничивал публичность судебных заседаний и освещение их в печати. С 1878 г. значительная часть политических дел была изъята из ведения судебных палат и передана военным судам.
Буржуазное преобразование общества не могло не затронуть армию – одну из основных составляющих государственной власти. Первые изменения были проведены уже в конце 50-х гг., когда были окончательно упразднены военные поселения.
Дальнейшее проведение военной реформы было связано с назначением в 1861 г. на пост военного министра Д. А. Милютина, профессора Академии Генерального штаба, придерживавшегося либеральных взглядов, человека выдающегося военного дарования. За 20 лет пребывания на посту министра под его руководством было осуществлено коренное переустройство русской армии.
С 1864 по 1867 г. численность армии была сокращена в полтора раза без снижения ее реального военного потенциала. В результате реформы военного управления были образованы военные округа, устранявшие чрезмерную централизацию и позволявшие быстро развернуть армию в случае войны.
С 1865 г. проводилась военно-судебная реформа. Были отменены телесные наказания, установлены три судебные инстанции: полковой, окружной и главный военный суды (они дублировали звенья общероссийской судебной системы).
В несколько этапов проводилось перевооружение армии (завершилось в 70-х гг.). Военное ведомство стимулировало производство стали, техническую реконструкцию оружейных заводов Тулы, Ижевска и др., строительство стратегически важных дорог к западным и южным границам страны.
В середине 60-х гг. была проведена реформа военно-учебных заведений. Кадетские корпуса были преобразованы в военные гимназии. Выпускники гимназий поступали в специальные военные училища. Усиливалась подготовка в системе высшего военного образования – Академии Генерального штаба, Артиллерийской, Инженерной, Военно-медицинской и вновь учрежденной Военно-юридической академиях. Вводилось обязательное повышение квалификации офицерского состава.