Проблемы с религиозным типом мышления действительно бывают и широко распространены, но они не заключаются в допущении людьми принципиальной возможности существования богов вообще или конкретного бога. Более того, даже непоколебимая убеждённость, что конкретный бог обязательно существует, также сама по себе не является проблемой. Чтобы эффективно выполнять свою основную биологическую задачу, людям нужны методы грамотного мышления и надёжные исходные знания. Если индивид вооружён этими инструментами, его бытие будет складываться весьма благополучно, и, независимо от того, во что он верит, он будет полезен не только самому себе и даже не только своим ближним, но часто и всему человечеству.
Совсем другое дело, когда религиозный человек из-за некоторых принятых им религиозных постулатов сознательно отказывается от эффективных методов мышления. В первую очередь это вредит ему самому, но иногда оборачивается вредом для окружающих. Например, известны случаи, когда верующие люди пытались прогнать болезнь ребёнка молитвами, не предпринимая других действий, и это приводило к печальным последствиям, вплоть до смерти. Исследования показали, что молитва не имеет лечебного эффекта и может совпасть с последующим улучшением здоровья больного только случайно. При этом эффективность современных научно признанных методов лечения и специально оборудованных больниц не вызывают никакого сомнения даже у подавляющего большинства верующих. К сожалению, когда верующий человек не владеет методами грамотного мышления, совпадения могут легко ввести его в заблуждение. В представлении такого человека есть эмпирическое знание, что больных помещали в больницы, и им вскоре становилось лучше, но также есть эмпирическое знание, что люди молились о выздоровлении больных, и им также вскоре становилось лучше. В такой ситуации преимущество одного метода над другим совершенно точно не является очевидным. Чтобы разобраться и выяснить, что медицина имеет безусловное преимущество перед молитвой, нужны, как минимум, дисциплина мышления, владение законами логики, представление о статистике, доступ к соответствующим статистическим данным, наличие специальных технических средств для такого доступа и умение хорошо ими пользоваться. На сегодняшний день более четверти человечества лишены такого достатка и образования, чтобы соответствовать этим требованиям, но даже в развитых странах специфические методы воспитания и обучения во многих семьях часто формируют людей, которые не владеют такими знаниями и навыками.
Как видно из описанной ситуации, вред здесь происходит не от верования в существование некоторого божества, а от отсутствия понимания научного метода. При этом религиозные люди совершенно правы, когда ссылаются на множество именитых учёных, которые в разные времена внесли значительный вклад в науку и при этом были верующими. Эти учёные умели критически мыслить, строить логически совершенные рассуждения, грамотно анализировать явления природы, они не верили, что бог может остановить летящую в них пулю и не лечили детей молитвами. Эффективность мышления таких людей была очень высока и позволила им значительно ускорить развитие общества, при этом их убеждённость в том, что за природными законами скрывается некое сверхъестественное и сверхразумное начало, никак не повредило ни им самим, ни обществу.
