В 1940 году Глущенко по заданию «сверху» организовывает выставку немецкого изобразительного искусства в Москве и выставку народного творчества СССР в Берлине. Параллельно художник добывал чрезвычайно ценную информацию, на основе которой был подготовлен доклад на имя Сталина и Молотова. В нем, среди прочего, говорилось: «Посланный ГУГБ НКВД СССР в Берлин разведчик Ярема сообщил: “Невзирая на заключенный с СССР договор о дружбе, правительство Германии активно готовится к войне против Советского Союза. Всеми средствами гитлеровцы маскируют приготовление с целью не дать повода к недовольству со стороны правительства нашей страны. В подготовке агрессии Германия широко использует украинские националистические организации под флагом борьбы за создание “самостоятельной Украины”. Для националистических ячеек создан ряд материальных правовых льгот, среди украинской эмиграции проводится значительная пропагандистская работа. Националисты назначаются на разные должности в министерстве внутренних дел, армии, полиции и пограничных войсках под предлогом подготовки государственных, политических и военных деятелей для будущей соборной Украины. Украинский научный институт, который работает в Берлине под руководством министерства пропаганды, в последнее время значительно активизировал свою деятельность и стал центром научно-исследовательской работы украинских националистических организаций, призванных научно обосновать антисоветскую работу. С 1939 г. институт фактически подчинен немецкой администрации, но персонал остался украинским. Это научное заведение развило бурную издательскую и исследовательскую деятельность специфического характера. В течение 1939–1940 годов им был издан военный немецко-украинский словарь для инфантерии, аналогичный словарь для пилотов и большой немецко-украинский словарь специально для военно-топографических, экономических и политических обзоров отдельных регионов Украины. Готовятся к печати карманные военные словари и детальные карты территории Украины. Научно-исследовательской работой института руководит профессор Кузеля, прежний «гетманец», связанный с бюро Розенберга. В разговоре с Яремой относительно немецко-оуновских планов на ближайшее время он сказал: “Я общаюсь со многими немецкими политическими деятелями и скажу со всей ответственностью: война с СССР не за горами. Мы и в настоящий момент много работаем, но пытаемся быть незаметными, потому что немцы заинтересованы в том, чтобы не заострять отношений с Советским Союзом. Для украинской национальной эмиграции Гитлером создан режим наибольшего благоприятствования”».
В последний день организованной Глущенко берлинской выставки «нагрянуло» высшее руководство Третьего рейха во главе с министром иностранных дел Риббентропом. Он вручил организаторам грамоты и ценные подарки. Обращаясь к Глущенко, Риббентроп отметил, что Гитлер высоко ценит талант художника как одного из лучших пейзажистов Европы и дарит, в том числе и на память о пребывании в Берлине, альбом с собственными акварельными рисунками.
Вернувшись в Москву, Глущенко передал этот альбом руководству разведки. С акварелями Гитлера захотел ознакомиться Сталин, альбом вернули художнику, когда началась война…
Глущенко долгое время «ходил по лезвию бритвы» — перед войной многие советские разведчики были репрессированы. К счастью, несмотря на доносы и провокации, ему по-прежнему доверяли и его ценили.
После войны Глущенко больше не пришлось заниматься разведывательной деятельностью, и он полностью посвятил себя живописи. А как художник он был плодовит: в его наследии — более десяти тысяч работ, которые сегодня хранятся в частных коллекциях и экспонируются в музеях Украины, России, Франции, Германии, США, Канады.
Глущенко работал в различных живописных жанрах, но излюбленной его темой был пейзаж. Тамара Бойко, генеральный директор украинского телеканала «Культура», общавшаяся с художником на протяжении трех десятилетий, вспоминала: «Пейзаж был для него всем. Николай Петрович стремился оставить украинскую природу на полотне такой, какой потомки ее не увидят, и считал, что не может быть в мире прекраснее натуры, чем берега Днепра. Поэтому он оставил для потомков серию пейзажей тех днепровских берегов, которые оказались на дне искусственного Кировоградского моря. Это море было для него личной болью. Где бы он ни был, он рисовал пейзажи. Он так стремился вернуться из Франции в Украину, потому что был частью этого пейзажа. Каждый клочок земли для него был темой для работы. И вместе с тем его картины приобретали философское содержание».
Художник завершил свой земной путь в Киеве и был похоронен на Байковом кладбище. Незадолго до смерти он отобрал 250 полотен, написанных в 1950-е годы, и попросил жену их сжечь. Позже картины нашли на антресолях в мастерской, и Министерство культуры передало их в музей для хранения, но без права экспонирования. Почему художник просил сжечь их, осталось невыясненным. Может быть, там были зашифрованы некие сведения, которые так и не попали к «заказчикам»?