После возрождения благодаря Саске, его личность изменилась. В то время как он всё ещё хотел получить тело Саске, он также понял, что полное копирование было ошибкой с помощью его наблюдений за Кабуто и проявил интерес к "иному пути" Саске. Желая увидеть путь Саске, он решил сражаться вместе с Учихой, вместо игнорирования войны Мадары, так как он планировал, и даже сделал себе приоритетом, чтобы залечить Цунаде и других Каге после их поражения перед тем как поторопиться на поле боя. Орочимару также, кажется, искренне заботится о благополучии Саске, в то время как он первоначально считал, что самое лучшее, что можно предпринять своевременно было выяснить, как бороться с Тоби, но быстро отказался от его своевременной задачи, когда Карин почувствовала, что Саске был на грани смерти. Орочимару также показал признаки сожаления, казалось, будучи опечаленным смертью его друга детства Джирайи. Годы спустя, он, кажется, стал в дружеских отношениях с Конохой, отправив его сына, Мицуки, в деревню.
Орочимару был сиротой, который стал учеником Хирузеном Сарутоби наряду с Джирайей и Цунаде. По сравнению с более непринуждённым Джирайей, Орочимару позиционировался, как гений — его таланты, знаний и решимость были рассмотрены Хирузеном, из-за чего он видел в нём вундеркинда, появляющегося раз в поколение.
Согласно Цунаде, Орочимару был извилистой личностью даже в детстве. Его отношение было садистским, предположительно из-за смерти его родителей. В какой-то момент после их потери, Орочимару нашёл белую змею возле могилы своих родителей, с объяснением Хирузена, что она представляет фортуну и возрождение вдохновили Орочимару учиться киндзюцу и получить знания о всех техниках. Джирайя предположил, что Орочимару пошёл по этому пути в попытке забыть свои болезненные воспоминания.
Во время Второй Мировой Войны Шиноби, Орочимару присоединился к Джирайе и Цунаде в битве против Ханзо, который дал им прозвище "Три Легендарных Шиноби" (яп. 伝説の三忍, Дэнсэцу но Саннин) Конохи в качестве награды за выживание в их сражение с ним, в то время как остальные члены их группы были легко убиты в процессе. На обратном пути в Коноху, они столкнулись с тремя сиротами Амегакуре, Орочимару предложил из милости убить их, прежде чем Джирайя решил вместо этого их обучить.
В аниме, Орочимару организовал последнее известное буйство Восьмихвостого в Кумогакуре, проникнув в деревню, в то время как он переоделся в ниндзя Облака и стал доктором Блю Би для того, чтобы обманом его принять специальные таблетки, вызывая гендзюцу, что позволяет ему извлечь хвостатого зверя. После чего, Орочимару получил отрезанный рог Восьмихвостого и собрал ДНК Блу Би от него.
ерез некоторое время после расформирования Команды Хирузена, Орочимару стал членом Анбу и присоединился к Корню, работая непосредственно с Данзо Шимурой, а также становится наставником для Анко Митараши. Это было в то время, когда Орочимару встретился с Кабуто Якуши, сопровождая Данзо в принуждении опекуна мальчика, Ноно, участвовать в миссии.
В то время как амбиции Орочимару волновало стать Четвёртым Хокаге, он намеревался использовать звание для своей собственных целей. Когда, наконец, Хирузен назначил Минато Намиказе своим преемником, Орочимару не видел больше оснований оставаться в Конохе и начал быть менее сдержанным своими действиями.
Это привело его к экспериментам на ДНК Хаширамы Сенджу с шестьюдесятью детьми, которых он похитил, чтобы воссоздать Стихию Дерева Первого, при этом имея помощь от Данзо. Полагая, что это провал, Орочимару не знал, что один ребёнок выжил и получил способности Стихии Дерева. Позже, он доработал процесс достаточно, чтобы передать клетки Хаширамы в вживлённую Шаринганами правую руку Шина Учихи, которую он пересадил Данзо.
Орочимару выполнял различные эксперименты на своих заключённых, некоторые из которых были его товарищи шиноби Конохи, которых он похитил. Он использовал их в качестве человеческих подопытных кроликов, разрабатывая техники, которые даруют ему бессмертие, конечным результатом стала техника Реинкарнация Живого Трупа. Некоторое время спустя, Орочимару был на окраине Киригакуре, тогда он нашёл Кимимаро, единственного оставшегося в живых члена клана Кагуя. Вскоре после этого, во многом благодаря Кимимаро, исследования Орочимару об источнике способностей Джуго привели его к найденной Пещере Рьючи и мастеру сендзюцу.