Забайкальский фронт – командующий маршал Р.Я Малиновский, член Военного совета – генерал-лейтенант А.Н. Тевченков, начальник штаба генерал армии М.В. Захаров – состоял из 17‑й, 36‑й, 39‑й и 53‑й общевойсковых, 6‑й гвардейской танковой, 12‑й воздушной армий, армии ПВО и конно-механизированной группы советско-монгольских войск.
1‑й Дальневосточный фронт – командующий маршал К.А. Мерецков, член Военного совета генерал-полковник Т.Ф. Штыков, начальник штаба генерал-лейтенант А.Н. Крутиков – имел в своем составе 1‑ю Краснознаменную, 5‑ю, 25‑ю и 35‑ю общевойсковые армии, Чугуевскую оперативную группу, 10‑й механизированный корпус, 9‑ю воздушную армию и армию ПВО.
2‑й Дальневосточный фронт – командующий генерал армии А.М. Пуркаев, член Военного совета генерал-лейтенант Д.С. Леонов, начальник штаба генерал-лейтенант Ф.И. Шевченко – включал в себя 2‑ю Краснознаменную, 15‑ю и 16‑ю общевойсковые армии, 5‑й отдельный стрелковый корпус, Камчатский оборонительный район (КОР), 10‑ю воздушную армию и армию ПВО.
Тихоокеанский флот – командующий адмирал И.С. Юмашев, член Военного совета генерал-лейтенант С.Е. Захаров, начальник штаба – вице-адмирал А.С. Фролов. Флот базировался на Владивосток (главная база), Советская Гавань и Петропавловск-Камчатский.
Краснознаменная Амурская флотилия базировалась на Хабаровск (главная база), Малую Сазанку на реке Зея, город Сретенск на реке Шилка и озеро Ханка. С началом боевых действий флотилии были подчинены все сторожевые катера пограничной охраны на реках Амур и Уссури и мобилизованные 106 судов гражданского речного пароходства. То есть все плавсредства, на которых можно было десантировать войска на противоположный (китайский) берег рек и доставлять туда технику и военное имущество.
Союзные монгольские войска вошли в состав конно-механизированной группы (КМГ), которой командовал генерал И.А. Плиев. Его заместителем по монгольским войскам был назначен генерал Ж. Лхагвасурон. Всего в КМГ насчитывалось свыше 42 тысяч человек, 610 орудий и минометов, 203 танка. Союзным войскам предстояло действовать на правом фланге Забайкальского фронта.
Монгольская Народная Республика в войну вступила 10 августа. Монгольская народно-революционная армия маршала Хорлогийна Чойбалсана наносила удар от Сайн-Шанда в пустыне Гоби по войскам князя Дэвана и Суйюаньской армейской группе японцев в направлении Калгана (Чжанцзякоу). Часть монгольских войск вошла в состав КМГ.
Все сухопутные, воздушные и морские силы были объединены под общим командованием – Главным командованием советских войск на Дальнем Востоке во главе с Маршалом Советского Союза А.М. Василевским, членом Военного совета генерал-полковником И.В. Шикиным и начальником штаба генерал-полковником С.П. Ивановым. Главнокомандующему подчинялись все три фронта, Тихоокеанский флот и Краснознаменная Амурская флотилия. Василевский начал свою деятельность в новой должности в Чите, куда прибыл в ночь на 5 июля.
Вместе с ним на Дальний Восток прибыли: командующий ВВС Советской Армии, Главный маршал авиации А.А. Новиков, заместитель командующего артиллерией Советской Армии маршал артиллерии М.Н. Чистяков, заместитель начальника войск связи генерал-полковник Н.Д. Псурцев, заместитель начальника тыла генерал-полковник В.И. Виноградов, ряд ответственных работников Наркомата обороны и Генерального штаба.
Для координации действий сил флота на морском театре военных действий во Владивосток прибыл народный комиссар ВМФ адмирал флота Н.Г. Кузнецов. Он же координировал действия Амурской флотилии с сухопутными войсками. Действиями авиации руководил командующий Военно-Воздушных Сил маршал авиации А.А. Новиков.
Перегруппировка войск проводилась в условиях строжайшей секретности. С целью соблюдения военной тайны советские военачальники прибывали на Дальний Восток под другими фамилиями и в других воинских званиях. Так, главнокомандующий А.М. Василевский во всех служебных документах и в переписке, радиограммах именовался «заместителем наркома обороны генерал-полковником Васильевым», а Р.Я. Малиновский – генерал-полковником Морозовым.
Прибывшие на Дальний Восток войска имели богатый боевой опыт. В состав Забайкальского фронта вошли прибывшие из района чешской Праги 6‑я гвардейская танковая и 53‑я армии, из Восточной Пруссии. Из-под Кенигсберга была переброшена 39‑я армия. На 1‑й Дальневосточный фронт из той же Восточной Пруссии прибыла 5‑я армия. Эти армия имели немалый опыт действий в гористой местности (6‑я танковая и 53‑я) и прорыва хорошо укрепленных районов (30‑я и 5‑я).
Окончательный вариант стратегической операции на Дальнем Востоке был выработан к 27 июля 1945 года. По плану советского Верховного Главнокомандования главный удар наносил Забайкальский фронт, самый сильный по своему составу. Ему предстояло в наступлении овладеть такими важными центрами Маньчжурии, как города Мукден, Чанчунь, Порт-Артур на берегу Желтого моря.