Убиение царевича, которому так сочувствовали простые люди, породило слухи, что к нему был причастен сам Годунов, желавший сделаться царем. А прикрепление крестьян к земле запрещало их свободный переход из одной земли в другую, что послужило новым толчком к народному возмущению.
Для Руси наступили тяжелые Смутные времена. Со смертью Федора Иоанновича прекратился царский род Рюриковичей, управлявших Русским государством (потомки Александра Невского).
Борьба за власть породила самозванцев, каждый назывался царевичем Дмитрием. Войска Лжедмитрия II разоряли города и издевались над духовными лицами, вместе с польско-литовским войском Лжедмитрий пытался посягнуть на сокровища Троице-Сергиевой лавры. Но братия сплотилась, и с молитвами на устах, с оружием в руках монахи держали оборону обители 16 месяцев. И хотя отряд иноков во много раз был меньше по количеству бойцов, чем войска мародеров, однако, несмотря на голод и цингу, монахи сумели отстоять свою лавру. Неприятельские войска с позором отступили. Эта геройская оборона послужила достойным примером для русских людей и вдохновила многих на смелые подвиги.
В Смутное время в Москве буйствовали поляки, оскорбляя православные святыни, стреляя в иконы и кресты, русский народ потерял терпение и веру, поэтому пример монахов многих вдохновил и поддержал морально. Кроме того, Троице-Сергиева лавра жертвовала на общественные нужды все свои сокровища, давая не только духовную поддержку, но и материальную. Архимандрит этой лавры Дионисий и келарь Авраамий Палицын по всем городам рассылали грамоты, призывая русский народ сплотиться против поляков, дабы спасти Православную Церковь, свою веру и землю от разорения недругов.
Патриарх Гермоген также посылал из заточения грамоты, одна из них попала в Нижний Новгород, где земский староста Козьма Минин Сухорукий, вдохновленный призывом святых отцов, обратился к горожанам с пламенной речью: «Продадим дворы. Заложим жен и детей наших, но выкупим отечество и веру!» Многие города последовали примеру нижегородцев и организовали ополчение, главным военачальником которого был избран князь Пожарский, а казначеем — Минин.
Литовско-польское войско было встревожено не на шутку таким мощным подъемом патриотизма русского народа, и боярин Салтыков вместе с польским гетманом потребовал от Гермогена, чтобы он послал к Пожарскому грамоту о роспуске ополченцев, на что патриарх ответил: «Да будет над нами милость Божия и наше благословение, изменники же да будут прокляты в сем веке и в будущем!» Вскоре патриарх умер, как полагают, его уморили голодом. Много примеров мужества, стойкости и верности являла Православная Церковь, именно она всегда давала надежду на спасение в самые трудные времена для России, укрепляла веру в победу и дарила свое благословение.
Первая половина XVII столетия знаменательна вступлением на престол первого царя из дома Романовых — Михаила Федоровича. Он был избран на трон в возрасте 16 лет. Находясь в селе Домнино около Костромы вместе со своей матерью, инокиней Марфой, Михаил подвергся большой опасности. В это время польские отряды, находившиеся поблизости, узнали об его избрании на царствование и решили убить Михаила. Своим спасением царь во многом обязан крестьянину Ивану Сусанину, который завел поляков в другую сторону от села Домнино, успев отправить к новому царю посланника, своего зятя Богдана Сабина, с предупреждением об опасности.
Любопытен и тот факт, что Михаил, получив грамоту об избрании на царство, вначале отказался от этой чести, а его мать говорила: «Русские люди измалодушествовались, позабыли, как служить царю. Идти теперь на царство — все равно, что идти на верную гибель».
Вступив на престол, Михаил Федорович взял на себя большую ответственность, ведь в то время казна была совсем пуста, у царя не имелось даже оружия, а Русская Земля еще была полна неприятелей: в Новгороде засели шведы, в Смоленской области — поляки. Молодому царю пришлось пойти на большие уступки внешним врагам, чтобы хоть в какой-то мере спасти государство. В Москву вернулся отец Михаила — Филарет, гостивший в то время в городе Иерусалиме. Иерусалимский патриарх посвятил Филарета в сан патриарха Московского. С его помощью царь стал мудрым, благожелательным правителем, при необходимости проявляя и твердую волю.
После Михаила Федоровича царствовал его сын Алексей Михайлович, который был любим русским народом, как ни один другой московский царь. Его восхваляли за кротость, поэтому он получил прозвище Тишайший. Его самым близким другом и наставником был патриарх Никон.
