Царь строго соблюдал все посты, прославился нищелюбием и милосердием, нищих приглашал даже во дворец в мясопустную неделю и вместе с ними обедал. Часто он посещал тюрьмы, раздавал заключенным деньги и пироги. Всегда принимал участие во всех церковных праздниках. В Вербное воскресенье, в память о входе Господа в Иерусалим, царь во время обряда вел осла за повод. Однако уже в этот период в России появляется много иностранцев, привнесших на Землю Русскую свои традиции: театральные представления и другие развлечения. Представители высшего света стали выписывать из стран Запада картины, зеркала, часы и многое другое.
История же великой дружбы царя с патриархом Никоном знаменательна многими событиями, отразившимися на жизни православных людей русских. Никон происходил из крестьянской семьи. После смерти детей он уговорил жену постричься в монахини и сам ушел в монастырь на Белом море, где снискал славу подвигами благочестия.
Царь Алексей Михайлович очень уважал строгих монахов и вскоре призвал Никона в Москву, где и сблизился с ним, часто прося совета и помощи в делах государственных. Вскоре Никон становится митрополитом в Новгороде. Однажды в этом городе хлеб так вздорожал, что народ начал роптать, обвиняя богатых в том, что те специально замыслили заморить людей голодом. Поднялся мятеж; патриарх вначале всех увещевал, затем обвинил в самовольстве, а после и проклял. Бунтовщики же напали на Никона и жестоко избили, так что тот тяжело болел и даже соборовался, но мятеж, к радости царя, немедленно прекратился.
С кончиной московского патриарха церковный собор избрал на это место Никона. Тот долго не соглашался, но все-таки, согласившись, принялся ревностно искоренять церковные беспорядки и решил исправить богослужебные книги. Поскольку они были еще рукописные, то по вине малограмотных переписчиков в тексте попадались ошибки. Никон с помощью просвещенных монахов пересмотрел все книги, велел их отпечатать и разослать по церквям. Однако некоторые священники отказывались исполнять службы по этим книгам, утверждая, что в них находится ересь. Тогда Никон стал наказывать этих священников и даже лишал некоторых сана. Приверженцы этих священников в свою очередь перестали посещать церкви и начали проводить службы по домам. Так в Православной Церкви возник раскол и появилось старообрядчество. Раскольники, боясь наказания, скрывались в лесах, уходили к казакам, все они люто ненавидели Никона и прозвали его еретиком и антихристом.
Никон же ревностно исполнял не только свои прямые обязанности, он во многом помогал царю в делах управления государством. Алексей Михайлович называл его «великим государем» и «своим искреннейшим другом». Из-за своей строгости патриарх нашел немало врагов, среди которых были и именитые бояре. Они стали наговаривать на Никона царю, якобы тот желает возвыситься наравне с ним. Долгое время царь оставался глух к этим наговорам, но «вода и камень точит»: вначале Алексей Михайлович перестал советоваться с Никоном в государственных вопросах, затем перестал приглашать его к себе, а после прекратил посещать даже патриаршее богослужение.
Никон же, чувствуя перемену в царе, после очередного богослужения официально и всенародно снял с себя патриаршее облачение и удалился в построенный им же Воскресенский монастырь (Новый Иерусалим). Разлад между царем и Никоном продолжался несколько лет, избрание нового патриарха откладывалось, наговоры же на Никона усиливались. Так, стали поговаривать, что Никон в своем монастыре наложил проклятие на царя и всю его семью. Наконец, царь созвал в Москве церковный собор, на который пригласил двух греческих патриархов. Никон, явившись в полном патриаршем облачении, держался достойным образом. Собор обвинил Никона, что тот самовольно оставил патриаршество, злоупотреблял проклятием и дал Воскресенскому монастырю название Нового Иерусалима. Никона лишили патриаршества (1666 год), священства и заточили в отдаленный Ферапонтов монастырь у Белоозера. В этом монастыре Никон прожил 15 лет. Царь же посылал ему меха, рыбу, плоды, деньги и называл в своих посланиях его «святым, великим старцем».
Хотя Россия претерпела многие испытания в этот период — смуты, раскол, однако как государство она окрепла и смогла уже не только сохранять свое национальное самосознание, но и помогать тем русским, которые страдали от угнетения поляков.
К концу XVII века Россия представляла собой самое обширное государство в Европе. Наиболее многолюдным городом была Москва, известная среди других городов своими храмами, царскими дворцами и палатами. В Московском Кремле жили царь и приближенные бояре; другие бояре и купцы жили в Китай-городе (ближайший к Кремлю посад, окруженный каменными стенами и башнями); в Белом городе (еще один посад, также окруженный каменной стеной, выкрашенной в белый цвет) селились дворяне, здесь же находились царские и боярские дворы с разными службами; простой же народ обитал в Земляном городе (самая крайняя и бедная часть Москвы).
