Все эти факты нарушений законности в работе органов и войск НКВД были хорошо известны политическому руководству страны, с нарушителями велась борьба, но принимаемые меры носили избирательный характер и не всегда были адекватными составу преступления.
С начала войны произошли серьезные изменения в положении советских спецслужб: если в предвоенный период большая часть их усилий была сосредоточена на борьбе с внутренними врагами, то с конца июня 1941 г. на первый план вышла внешняя угроза. Высшими органами власти и управления СССР, и прежде всего ГКО, в кратчайший срок была создана нормативная база деятельности военной контрразведки НКВД, судебной и внесудебной политики, которая позволила на правовой основе вести борьбу со спецслужбами Германии, ее союзников и разного рода уголовными элементами.
Возрастание репрессивной политики государства было обусловлено военным временем, возрастанием преступности, активизацией противников советской власти. При этом претерпел ограничения ряд правовых норм. Закон нередко подменялся понятием политической целесообразности, проявлением субъективизма в нормотворчестве, что выражалось в законодательном оформлении ГКО СССР, других высших органов власти, личных установках Сталина. И ведомственные подзаконные акты НКВД нередко вступали в противоречие с конституционными нормами. Недостатки в законоприменительной практике, произвольное толкование норм права негативно отражались на оперативно-следственной работе, вели к деформированному восприятию оперативной обстановки руководящим и оперативным составом, что создавало почву для различных фальсификаций.
Правовой статус органов и войск госбезопасности четко определил кодификацию воинских преступлений, порядок выполнения своих обязанностей всеми управления и службами, войсковыми формированиями НКВД, взаимодействие следственных органов с военными трибуналами.
К началу Великой Отечественной войны в СССР сложилась разветвленная структура органов, собиравших разностороннюю информацию об общественных настроениях населения. Подготовкой материалов занимались органы госбезопасности, партийные организации, редакции газет, политические органы Красной армии и Военно-Морского флота. С начала войны одной из важнейших задач, возложенных на органы госбезопасности, стало систематическое информирование советского руководства практически по всем, наиболее существенным проблемам жизни общества, в том числе и имевшим важнейшее значение для укрепления обороноспособности страны. К тому же, достоверная информация должна была противостоять нацистской агитации и пропаганде, являвшихся составной частью «психологической войны», призванной по замыслам противника парализовать волю советского народа и его Вооруженных мил к сопротивлению.
Во время войны задачи военной разведки и контрразведки в значительной степени отличались от ее задач в мирное время, главным образом, вследствие увеличения темпов получения и обработки разведывательной информации. Это объясняется и тем, что при ведении военных действий не было времени на длительные исследования и анализ сведений в штабах армий и фронтов. При этом своевременная и точная оперативная информация в военное время приобретала важное значение, потому что от этого зависели пресечение вражеской деятельности антисоветских элементов и устранение всех недочетов в обеспечении боевой деятельности частей и соединений Красной армии. Еще известный деятель Великобритании О. Кромвель говорил: «Управлять, значит предвидеть, а предвидеть можно только тогда, когда глава государства своевременно и хорошо информирован». И оперативная информация, т. е сведения, получаемые в результате осуществления разведывательной, контрразведывательной и оперативно-розыскной деятельности, давала возможность грамотно распорядиться ими и сделать прогноз развития событий.
Информация ОО НКВД являлась составной частью докладных записок, сводок и специальных сообщений органов госбезопасности на имя высшего политического руководства страны. Их темы выбирались в зависимости от важности происходивших военных или политических событий. В первые недели речь шла о приграничном сражении, упорных оборонительных боях Красной армии, начавшейся эвакуации западных районов страны, усилении борьбы с дезертирством и других.
