Военная прокуратура возбудила дело по факту мятежа высшего генералитета и приступила к расследованию. Первые аресты провели сами же армейские офицеры, осознав, что стали жертвами политического экстремизма своих командиров. Так, младшими офицерами были арестованы начальник штаба 9-й пехотной дивизии бригадный генерал Одиссеос Ангелис, и начальник генштаба генерал-лейтенант Афанасиос Фронтистис. Генералу Григориосу Спантидакису, одному из главных действующих лиц переворота, удалось скрыться.
Затем, в ходе расследования, были объявлены в розыск, и впоследствии арестованы многие высокопоставленные военные, как действующие на момент переворота, так и в отставке. Повязали таких деятелей, как военный теоретик, полковник Аристоменис Антонакис, известный своим антикоммунизмом; начальник службы безопасности генерал-майор Гогусис, автор преступного плана «Перикл»; глава Национальной разведывательной службы KYP генерал-лейтенант Александрос Натсинас; правые политики — бывший адъютант короля Георга II, генерал-майор в отставке Константинос Вассос и полковник в отставке Константинос Маниадакис.
При разборе завалов на месте рухнувшего здания министерства обороны строители обнаружили не один десяток сейфов с документами. По приказу нового начальника генштаба, генерал-лейтенанта Константиноса Маргаритиса, до путча — начальника штаба ВВС, каждый сейф вскрывали в присутствии понятых, описывали и тщательно изучали его содержимое. Один из найденных сейфов принадлежал бывшему начальнику генштаба Фронтистису, а до него — тоже бывшему начальнику генштаба Константиносу Девасу.
При изучении содержимого сейфа выплыли на свет важнейшие, разоблачающие правый заговор документы, неопровержимо свидетельствовавшие о существовании в Греции тайной военизированной организации, по существу — секретной армии, носившей наименование «Греческие диверсионные группы». Вдохновителем их организации и одним из непосредственных руководителей в документах был назван генерал-лейтенант Константинос Девас.
В тех же документах было указано, что подобные секретные армии существуют под разными названиями во всех странах НАТО. В Норвегии они именовались ROC, в Дании — «Абсалон», SDRA8 в Бельгии, «Гладио» — в Италии. Официально целью существования этих армий была организация партизанской борьбы в случае советской оккупации Западной Европы, но реально они использовались для борьбы с левой и левоцентристской оппозицией, причём борьба проводилась абсолютно незаконными, террористическими методами.
Секретные армии были неподконтрольны правительствам и парламентам стран, в которых они действовали, и подчинялись непосредственно комитету по специальным операциям НАТО. Обучение, тренировки и снабжение производились при полном содействии ЦРУ и английской разведки SIS. Участие Великобритании в создании этих секретных армий в конце 40-х оказалось едва ли не большим, чем США.
По совету эмиссара Коминтерна избранный вскоре после референдума премьер-министром Андреас Папандреу не торопился публиковать результаты расследования. Греческая прокуратура обменялась информацией с советской разведкой, у которой уже было составлено большое досье на секретные армии «Гладио». Решено было обнародовать эту информацию в наиболее удобный момент, когда скандал мог нанести репутации НАТО максимальный урон. У греческого народа уже накопился длинный счёт к НАТО, не меньший, чем к ЦРУ.
Информационному обеспечению операции по подавлению переворота в Греции было уделено особое внимание. Папандреу-младший привёз из Парижа несколько десятков репортёров европейских газет и телевидения. Им была предоставлена возможность осмотреть тюрьмы и стадионы, куда путчисты свозили арестованных из числа левой оппозиции, побеседовать с освобождёнными из тюрем людьми. Репортёры были в шоке от множества похожих свидетельств о преступлениях хунты. Люди показывали им следы пыток, рассказывали о случаях убийств и жестокого обращения. Труп Георгиоса Папандреу ещё висел вверх ногами на стадионе, когда туда вместе с матросами греческого флота приехали первые европейские репортёры, его вынимали из петли под объективами телекамер.
Телевидения в Греции не было, и советское правительство предоставило в аренду европейской информационной миссии передвижной телецентр. В Париже временно развернули контейнерную приёмную станцию системы «Орбита» и гнали репортажи из Афин через спутник. Преступления хунты увидела вся Европа. Люди ужаснулись, увидев, что успели натворить фашисты за одну ночь.
Репортажи из Греции, переданные по каналам информационных агентств, показывали и в США. Реакция американцев на действия хунты была крайне негативной. Среди зрителей было много ветеранов войны, освобождавших узников гитлеровских концлагерей. Увиденное не могло не вызвать в их памяти очевидные параллели с событиями 2-й мировой войны. В американской прессе появилось множество разгромных статей о греческих путчистах, высказывались требования международного суда над ними, по аналогии с Нюрнбергским трибуналом.
