В 1873 году Пыпин издал книгу «Характеристики литературных мнений от двадцатых до пятидесятых годов», где предметом рассмотрения стали взгляды русских мыслителей и политиков, в том числе Чаадаева, славянофилов, Белинского, Жуковского, Пушкина и Гоголя.
Со слов Алексея Николаевича Веселовского, считавшего себя учеником Пыпина, тот так характеризовал русскую литературу 50–60‐х годов XIX века: «Я считаю для себя счастьем, что был свидетелем, иногда близким, этой оживленной поры, которая стала уже исторической эпохой русской литературы. Это была пора в своем роде единственная – редкое соединение дарований, богатых и разнообразных; это было настоящее представительство национального гения, и мы видели потом, что Европа с изумлением открыла в созданиях этой литературы и русский художественный гений, и русскую душу».
Пыпин указывал на перелом, происшедший в русской литературе на рубеже веков: «На переходе от XVII к XVIII веку мы встречаем вообще множество разнородных и особливо переводных произведений, которые с очевидностью указывают на возникновение новых умственных интересов: являются переводные сочинения по разным отраслям знания, опыты исторических компиляций, и наконец ко временам Петра среди людей, воспитанных концом XVII века, находим даже людей, которые ставят вопросы о государственном и народном быте и его наилучшем устройстве, как знаменитый Посошков. Это время отмечено также большою массой повествовательной литературы, главным образом переводной, но среди которой были наконец и собственные опыты любовной повести с романическими приключениями. Не определенная сполна до сих пор, эта литература, распространившаяся особенно, по-видимому, именно с петровских времен, находится в тесной связи с переводною повестью XVII века, а с другой стороны, составляет переход к печатной литературе переводного романа второй половины XVIII века».
Ученый утверждал, что «язык и литература, чтобы достигнуть истинно-всемирного значения, должны стать орудием идей и знаний, представляющих общечеловеческий интерес, и ознаменовать себя великими произведениями науки и поэзии, которые только и дадут им право занять место между передовыми нациями человечества. Вне этих условий язык не может ни приобрести «всемирного» значения, ни претендовать на изгнание действительно всемирных языков оттуда, где они уже успели утвердиться благодаря своему культурному значению».
Пыпин является также автором книг: «Белинский, его жизнь и переписка» в 2 томах (1876), «Сводный старообрядческий синодик» (1883), «История русской этнографии» в 4 томах, «История русской литературы», в 4 томах (1898–1899), «М.Е. Салтыков. Идеализм Салтыкова. Журнальная деятельность 1863–1864» (1899), сочинения Императрицы Екатерины II, на основании подлинных рукописей и с объяснительными примечаниями академика А.Н. Пыпина» (т. 1–4, 7—10 (1901), «Н.А. Некрасов» (1905), «Панславизм в прошлом и настоящем» (1913), «Русское масонство. XVIII и первая четверть XIX в.» (1916), «Исследования и статьи по эпохе Александра I» в 3 томах (1916–1918), и др.
