Поданным ИНДЕМа, второй виток изменения природы российской коррупции произошел на рубеже столетий, а заметное ухудшение ситуации с коррупцией пришлось на середину 2000-х годов. Систематические измерения в сфере российской коррупции, осуществлявшиеся с помощью четырех индексов (Corruption Perceptions Index (Transparency International), Corruption (Freedom House, «Nations in Transit»), Corruption (Heritage Foundation, «Index of Economic Freedom»), Control of Corruption (World Bank, «World Governance Indicators»)), обнаружили сходные тенденции: до 2004–2005 годов уровень коррупции последовательно снижался, а затем начал вновь расти. Во время второго президентского срока В. Путина России стремительно опустилась с 90 на 126 место в соответствии с индексом восприятия коррупции. Менее чем за пять лет средний размер взятки в России вырос с 9 000 рублей до 236 000 рублей. В качестве яркой особенности отечественной бизнес-коррупции специалистами ИНДЕМа отмечено следующее: одна десятая всех коррупционных сделок нацелена на органы законодательной и судебной власти, все остальное идет в административные органы. Абсолютными лидерами являются органы, ведающие противопожарной безопасностью, вопросами здравоохранения, эпидемиологическим контролем, а также налоговые, таможенные и лицензирующие органы. Еще одна характерная черта российской коррупции 2000-х, выявленная экспертами ИНДЕМа: если раньше чиновник брал взятку за совершение каких-либо противозаконных действий или же за игнорирование совершение таких действий взяткодателем, в начале XXI века чиновники начали брать взятки за выполнение своих должностных обязанностей.
Российская нормативно-правовая основа противодействия коррупции выглядит весьма внушительно. «Первой ласточкой» в этой сфере стал изданный 4 апреля 1992 года Указ президента Б. Ельцина «О борьбе с коррупцией в системе государственной службы». Ряд антикоррупционных мер был предусмотрен положениями Федерального закона от 31 июля 1995 года № 119-ФЗ «Об основах государственной службы Российской Федерации», которые в дальнейшем были ужесточены Федеральным законом от 27 июля 2004 года № 79-ФЗ «О государственной гражданской службе Российской Федерации».
В 1997 году увидела свет Концепция национальной безопасности в которой было отмечено, что серьезные ошибки, совершенные на начальной стадии проведения реформ, в значительной мере способствовали росту коррупции в стране. В принятой в 2009 году Стратегии национальной безопасности развитие антикоррупционной законодательной базы было упомянуто в качестве одного из приоритетов. Стратегические вопросы были отражены в Национальном плане противодействия коррупции (31.07.2008); также в первоначальной редакции данного документа были предусмотрены меры, направленные на предотвращение коррупции, в том числе:
• установление особых требований к кандидатам на судейские должности и должности государственной гражданской службы;
• введение общественного и парламентского контроля за соблюдением антикоррупционного законодательства;
• анкикоррупционная экспертиза нормативно-правовых актов;
• установление обязанности для государственных и муниципальных служащих сообщать о случаях коррупции и иных подобных правонарушениях, о которых им стало известно в рамках исполнения своих должностных обязанностей;
• введение антикоррупционных стандартов (единой системы запретов, ограничений, обязанностей и разрешений, направленных на предотвращение коррупции).
Следующим важным этапом стал Федеральный закон «О противодействии коррупции» № 273-ФЗ (25.12.2008), определивший ключевые понятия в этой сфере и предусмотревший ряд антикоррупционных мер. Хотя данный имеет рамочный характер и содержит ряд отсылочных норм и декларативных положений, тем не менее с его помощью была заполнена существенная правовая лакуна, и впервые противодействие коррупции было закреплено в федеральном законе. К недостаткам данного закона, в первую очередь, следует отнести излишнее узкое законодательное определение коррупции, кроме того ряд коррупционных действий, которые признаются таковыми в большинстве зарубежных стран (например, коррупция в сфере лоббизма), не являются уголовно наказуемыми деяниями по российскому законодательству.
