Король знал это, и он не был готов ждать годы, чтобы решить проблему тамплиеров. В августе он лишился своего четвертого сына, Роберта, который умер в возрасте одиннадцати лет. Но династия была вне опасности: у него осталось еще трое сыновей. Но, спустя два года после смерти жены, эта новая тяжелая утрата усилила его решимость очистить королевство. И еще был Гийом де Ногаре, который призывал к немедленным действиям. Для него возбуждение дела против тамплиеров было не только делом общественного здоровья, призванным наказать провинившийся орден, но и дополнительным оружием для влияния на решения Папы, разменной монетой в деле Ананьи и Бонифация VIII, чтобы добиться снятия с себя отлучения. Он также оказался лидером в начинающемся большом деле: 22 сентября он был назначен хранителем королевской печати, а значит, канцлером без титула, и писец канцелярии, записавший это событие, отметил, что это произошло во время заседания Совета, посвященного подготовке к аресту тамплиеров: "Печать была передана мессиру Гийому де Ногаре, когда рассматривался вопрос об аресте тамплиеров". Таким образом, эти две вещи связаны между собой, именно Ногаре руководил операцией. Но можем ли мы утверждать, как это делает Робер-Анри Ботье, что "с этого момента реальность власти больше не принадлежала Филиппу Красивому: она перешла к Ногаре и небольшой группе людей, политически связанных с ним, Плезиану, Латилли и, очень быстро, к камергеру короля, Ангеррану де Мариньи"? Это кажется чрезмерным. Одного изучения дипломатических источников, на которых основывает свое заявление Робер-Анри Ботье, недостаточно, чтобы доказать, что король больше не является хозяином положения. Хотя он поручил Ногаре руководить процедурой, он держал ее в своих руках и мог в любой момент остановить или изменить ход событий. Он оставался верховным арбитром, а иногда вмешивался лично.
Во время заседания Совета в аббатстве Мобюиссон, где в сентябре обсуждалась стратегия, которую необходимо было применить, он выступил против осторожной позиции, рекомендованной Жилем Айселином, который хотел, чтобы Папа был уведомлен первым, как того требует каноническое право в вопросах ереси. Поскольку король был убежден, что Папа не будет действовать, он решил довольствоваться согласием инквизитора Франции, который быть рукой Папы в этой области. Это была лишь уловка: инквизитором Франции был доминиканец Гийом Парижский, духовник короля, полностью преданный государю. 22 сентября он написал инквизиторам Тулузы и Каркассона, попросив их сотрудничать в расследовании, которое вот-вот должно было начаться. Он заявил, что король обсуждал это с Папой в Лионе и Пуатье, и намекнул, не уточняя, что Климент V одобрил арест, поскольку преступление тамплиеров было "жгучим позором для небес", "горьким делом", "прискорбным делом", "позорнейшим" преступлением, из-за которого "земля, несомненно, будет перевернута, стихии нарушены, божественное имя подвергнется презрению, истина сбита с толку, стабильность христианской веры разрушена".
Поэтому в начале сентября было принято решение внезапно арестовать всех тамплиеров во Франции и добиться от них признания, прежде чем Папа успеет отреагировать. 14-го числа было составлено и отправлено письмо бальи и сенешалям. В нем говорилось, что "горькая вещь, прискорбная вещь, вещь, о которой ужасно думать […], отвратительное преступление […], вещь совершенно бесчеловечная, благодаря сообщению нескольких заслуживающих доверия людей, достигла наших ушей". Дело в том, что "братья ордена рыцарства Храма, скрывающие волка под личиной агнца и в одеянии ордена жалко оскорбляющие основы нашей веры", отреклись от Христа, плюют на крест, предаются непристойным жестам и "обязывают себя, по обету своей профессии и без страха оскорблять человеческий закон, отдаваясь друг другу, как только от них этого потребуют". Следовательно, "поскольку истина не может быть полностью обнаружена иным способом, и поскольку горячее подозрение охватило всех […], мы постановили, что все члены упомянутого ордена в нашем королевстве должны быть арестованы, без исключения, содержаться в тюрьме и переданы на суд Церкви, и что все их имущество, движимое и недвижимое, должно быть конфисковано, передано под нашу руку".
Выдавались точные инструкции о том, как действовать. Приказ должен был храниться в строжайшей тайне до дня ареста. Планировку зданий занимаемых тамплиерами необходимо было изучить, совершив визит за несколько дней до этого под предлогом подготовки сбора децима, а чтобы снять любые подозрения, предлагалось посетить и другие культовые здания. Таким образом, можно было узнать все выходы, а также расположение имущества и людей. Утром в день "Д" чиновники короля, в сопровождении надежные людей должны были арестовать тамплиеров и поместить в тюрьмы, где пригрозить пытками, чтобы они немедленно признались, должна была также составлена опись конфискованного имущества.
