Через несколько дней королевская семья оставила Буа де Венсен и, пообедав в Тюильри, отправилась ночевать в Буа де Булонь, в Мадридский замок (до наших дней не сохранился). Париж превратился в настоящий укрепленный лагерь, где вооруженный народ ежедневно ждал штурма бунтовщиков. Атмосфера становилась все более зловещей из-за свирепствовавшей там чумы. Приток в город жителей соседних деревень резко увеличил количество ее жертв. Этим летом Карл IX и герцог Орлеанский чаще всего останавливались в Венсен. Том временем война двух лагерей распространилась на все королевство.
Оказавшись перед необходимостью вести войну, регентша запросила помощи у Филиппа II, герцога Савойского и Папы Римского. Конде и Колиньи, со своей стороны, могли обратиться только к Англии и протестантским принцам в Германии. Последние за высокие проценты предоставили людей и субсидии. Королева Елизавета потребовала возвращения Кале, по договору Като-Камбрези вновь отошедшего к Франции, а в залог немедленную сдачу Гавра. 20 сентября 1562 года в Хемптон Кем представители обоих принцев согласились подписать это унизительное соглашение. Захватив Пуатье (30 мая) и Бурж (31 августа), королевская армия направилась к Руану, бывшему в руках гугенотов. Екатерина остановилась недалеко от нормандской столицы в Пон-де-Ларш. Ее сопровождал герцог Орлеанский. 3 ноября он присутствовал при аудиенции королевы, данной англичанину Смиту. Смит заменял посла Англии Трокмортона, вынужденного покинуть Париж, где он был уже не в безопасности. Что бы ни было на уме у регентши, она не хотела рвать отношения с Англией, несмотря на то, что Елизавета поддержала ее мятежных подданных и потребовала у них сдачи французского порта.
К счастью, события развивались быстрее и благоприятнее, чем было предусмотрено. Первая гражданская война была не очень длительна. Через несколько дней после взятия Руана скончался Антуан де Бурбон из-за последствий удара аркебузой при взятии города (17 ноября). 19 декабря Франсуа де Гиз одержал победу над гугенотами в сражении при Дре. Главы обеих армий, Конде и старый Монморанси были захвачены в плен, маршал де Сен-Андре убит. Екатерина и ее сыновья смогли, наконец, вернуться в Париж, куда они прибыли 22 декабря. П. Паскаль передает, что как только стало известно о победе в Дре, король и королева поспешили в Париж. В большом соборе Парижской богоматери пели