Обстановка, сложившаяся на южных подступах к Ленинграду, была необычайно тяжелой. Еще с 8 августа немцы развернули генеральное наступление на город, вышли к Неве, а 8 сентября к берегу Ладожского озера, перерезав тем самым сухопутную связь города с остальной страной. Одновременно их дивизии наносили непрекращающиеся удары на ленинградском направлении через Красногвардейск (ныне Гатчина), Пулковские высоты и вдоль берега Финского залива. Нашим войскам пришлось оставить южные пригороды, и в бинокль немецкие офицеры уже могли наблюдать в солнечный день купол Исаакиевского собора и шпиль Петропавловской крепости. Казалось, еще немного, и город падет. На этот случай все корабли КБФ, включая субмарины, были приготовлены к подрыву и затоплению. В этой обстановке в штабе бригады подлодок (в начале сентября все подводные силы КБФ были сведены в одну бригаду) был разработан план прорыва лодок через Балтийские проливы. В годы Первой мировой войны этим маршрутом на Балтику проникли несколько британских субмарин, а в 1939 году в обратном направлении прорвались польские подлодки «Вилк» и «Ожел». Трудно сказать, насколько реальным был разработанный в штабе бригады план, особенно если учесть, что советским лодкам предписывалось прорываться не через более глубоководный пролив Малый Бельт, а через разделяющий Швецию и оккупированную Данию пролив Эресунд, глубины на котором в самом мелком месте составляют 8–8,5 метра. Пройти такое мелководье в подводном положении «эски» не могли, а проход в надводном был практически самоубийственным мероприятием. Тем не менее экипажи группы, куда входила и С-7, взялись за подготовку к прорыву, шансы на успех которого сами моряки оценивали как один на миллион. К счастью, вскоре обстановка начала стабилизироваться. После этого была отменена и операция по прорыву на Север. Вместо нее вечером 28 сентября С-7 вышла к острову Лавенсари, где находилась в готовности на тот случай, если немецкий флот попытается войти в Финский залив и поддержать огнем своих орудий наступление на Ленинград. Подобных попыток, как известно, немцы не предприняли, и утром 21 октября субмарину вернули в Кронштадт. Там Лисин получил весьма необычную боевую задачу – выйти в Нарвский залив, откуда по ночам вести обстрел береговых объектов, где, по данным разведки, противник сосредотачивал войска и запасы военных материалов. Сергей Прокофьевич с максимальным качеством выполнил и это задание. В течение нескольких ночей субмарина выпустила по берегу более четырех сотен снарядов, но причиненный ими ущерб в целом оказался незначителен. Из-за сложности с определением своего места относительно находившихся в глубине территории береговых целей большая часть снарядов упала на пустыри, пострадал лишь кирпичный завод в селении Асери. Впрочем, такие обстрелы и не могли иметь иного результата. Когда их план был выполнен, командование предложило Лисину задержаться на позиции на столько дней, на сколько он сочтет возможным. Штурман С-7 Михаил Хрусталев так описал связанные с этим события в своем походном дневнике:
