Войска Моголов также активно действовали на северных, северо-восточных и северо-западных границах империи и в центральной Индии, принуждая к покорности различных местных правителей и покоряя непокорные племена. Они отразили нападение Назр Мухаммад-хана, узбекского правителя Балха, на Кабул. В Декане Шах-Джахан стремился раз и навсегда уничтожить Ахмаднагар. Операции начались во время преследования Хан-и-Джахана. Сомнений в том, что Моголы добьются успеха, было мало, и многие вожди Деккана перешли на сторону Моголов. Среди них были и первые маратхи, поступившие на службу к Моголам. Сердцем царства Низам-Шахи теперь была великая крепость и город Даулатабад. Когда моголы начали осаду Даулатабада после захвата нескольких менее значительных крепостей, низам-шахи во главе с Фатх-ханом, сыном Малика Амбара, приняли суверенитет моголов. Во время этой кампании Мумтаз Махал, которая, как обычно, сопровождала Шах-Джахана, умерла в Бурханпуре 7 июня 1631 года после родов их четырнадцатого ребенка. Опустошительное горе Шах-Джахана способствовало его решению принять покорность Низам-Шахи и вернуться в Индостан в 1632 году. Вскоре после этого началось строительство ее великолепной гробницы, Тадж-Махала, которое продолжалось до 1659 года.
После ухода Шах-Джахана Адил-Шахи из Биджапура попытались получить контроль над Ахмаднагаром в качестве буфера против Моголов. Фатх Хан перешел на сторону моголов. Махабат Хан, командуя силами Моголов, осадил Даулатабад и заставил Фатх Хана сдаться, тем самым положив конец истории Ахмаднагара как независимого княжества. Несколько офицеров Низам-Шахи, включая вождя маратхов по имени Шахджи Бхонсле, продолжали сопротивляться. В 1634 году Махабат Хан осадил крепость Адил-Шахи в Паренде, но потерпел неудачу и вскоре умер. Шахджи и адиль-шахи продолжали оказывать давление на могольские войска. Однако в 1635 году император Великих Моголов лично вернулся в Декан. Он координировал операции против Шахджи и Адил-Шахи. Чтобы предотвратить катастрофу, Адил-Шахи договорились об урегулировании, предложив признание суверенитета Великих Моголов, дань и военное сотрудничество против Шахджи. Затем Шах-Джахан выступил против Голконды, которая согласилась на аналогичное соглашение. Ее шиитские кутб-шахи должны были называть в хутбе имя Шах-Джахана, а не сефевидского шаха. Моголы обещали защищать Голконду от Биджапура. Договоры с Голкондой и Биджапуром символически включили два уцелевших деканских княжества в состав империи Великих Моголов и обеспечили почти два десятилетия стабильности в Декане.
Разрешение затянувшегося кризиса в Декане позволило Шах-Джахану обратить внимание на другие места. Под "другими местами" подразумевался северо-запад и особенно Кандагар, который оставался в руках Сефевидов с 1622 года. В 1636 году Шах-Джахан предложил союз с османами и узбеками против Сефевидов и предложил сефевидскому губернатору Кандагара взятку за сдачу города. Сначала из этой попытки ничего не вышло, но два года спустя она принесла неожиданные плоды. Губернатор, Али Мардан Хан, сдал город Моголам вместо того, чтобы подвергнуться вероятной казни от рук сефевидского правительства. Надеясь сохранить это удачное приобретение, не вступая в войну с Сефевидами, Шах Джахан предложил Шаху Сафи финансовую компенсацию и союз против узбеков. Сафи не хотел соглашаться на сделку, но османская угроза не позволила ему действовать. Овладение Кандагаром позволило Шах-Джахану приступить к завоеванию Центральной Азии - мечте его семьи со времен Бабура.