В это время встал вопрос о преемственности Акбара. Салим поднял восстание против Акбара в 1599 году, но не получил поддержки. В начале 1605 года Даниял умер по естественным причинам, и физическое состояние Акбара стало ухудшаться. Казалось, что Салим добьется успеха без борьбы. Но тут появился соперник в лице старшего сына Салима, Хусрава. Его поддержали раджа Ман Сингх из Амбера и хан-и Азам Мирза Азиз Кука, которые были близки к Акбару и опасались отстранения от власти. Однако большинство офицеров поддержали Салима. Акбар умер 15 октября 1605 года. Он взошел на шаткий трон еще мальчиком, а оставил после себя империю, господствующую на субконтиненте.
Джахангир
Салим занял трон под именем Джахангира и назначил на высокие посты своих сторонников. В следующем году Хусрав бежал от двора, что было расценено как бунт. Очевидно, он опасался отстранения от престолонаследия и тюремного заключения, но его прежние сторонники не поддержали его. Джахангир преследовал сына с огромной силой, победил и захватил его в плен, а также казнил многих его сторонников. Среди жертв был и Гуру Арджун Сингх, пятый лидер сикхской веры, который на самом деле не поддерживал Хусрава, но дал отчаявшемуся юноше свое благословение. Чисто политическая месть Джахангира за акт доброты по отношению к отступнику положила начало отравлению отношений между сикхами и мусульманами, которое привело к векам насилия.
Хотя Джахангир не был ни энергичным, ни одаренным, он эффективно правил с 1605 по 1622 год. Могольский гарнизон Кандагара отбил осаду сефевидов в 1606 году. На юге Моголы наконец-то завоевали Мевар. Кампании 1606, 1608 и 1609-1611 годов не смогли положить конец сопротивлению Сисодии, несмотря на многочисленные победы на поле боя. В 1614 году на поле боя вышел второй сын Джахангира, Хуррам. Его войска опустошили страну и привели к голодной покорности рану Амара Сингха. В обмен на признание власти Моголов Амар Сингху было позволено сохранить все свои территории и не платить дань. Было лишь одно символическое условие: Читор, столица, представлявшая притязания Сисодии, не могла быть укреплена или отремонтирована. Это подчинение раны Амара Сингха стало величайшим триумфом правления Джахангира, но это была заслуга Хуррама, а не Джахангира. За эту победу Хуррам получил титул, под которым он известен в истории, - Шах-Джахан.
Слабость Джахангира дала больше влияния его министрам и доверенным лицам, чем люди на этих постах имели при других правителях Великих Моголов. Самой известной из них, конечно же, была Нур Джахан, на которой Джахангир женился в 1611 году. Романтическая история о привязанности Джахангира к ней доминирует в популярных рассказах о царствовании. Нур Джахан, безусловно, была самой влиятельной женщиной в истории Великих Моголов; она задала непреходящий образец женской одежды. Но ее действия стали причиной многолетних беспорядков в империи, а ее политическое влияние во многом зависело от политических и административных способностей ее отца и брата, а не от ее власти над мужем. Грязная реальность попыток Нур Джахан увековечить свою власть ценой имперского единства и семейной гармонии перевешивает романтику. Отец Нур Джахан, носивший титул Итимад ад-Дальва, был одним из ведущих деятелей режима до самой своей смерти в 1622 году. Ее брат Асаф-хан занимал видное положение после брака Нур Джахан с Джахангиром до самой своей смерти в правление Шах-Джахана. Он извлек выгоду как из брака своей сестры с Джахангиром, так и из брака своей дочери Арджоманд Бану Бегум (позже известной как Мумтаз Махал) с Шах-Джаханом. Третьей доминирующей фигурой того времени был Махабат Хан, выдающийся и решительный полководец. Нур Джахан, Асаф Хан, Шах Джахан и Махабат Хан были четырьмя доминирующими фигурами при дворе Джахангира. Но прежде чем обсуждать эту борьбу, мы должны обратить внимание на Декан и пятую великую фигуру того периода, Малика Амбара.
Малик Амбар был одним из величайших африканских государственных деятелей и воинов в истории. Привезенный с Африканского Рога в качестве военного раба, он стал эффективным правителем Ахмаднагара. Его стратегия избегать сражений с Моголами, преследуя их войска и угрожая их путям снабжения, стала образцом сопротивления власти Моголов в Декане. В период с 1608 по 1616 год он разгромил ряд могольских экспедиций. В 1617 году Джахангир послал в Декан Шах-Джахана. Его сила и престиж убедили Малика Амбара и его союзников в Биджапуре и Голконде признать суверенитет Великих Моголов, выплатить дань и вернуть территории, завоеванные Маликом Амбаром, под контроль Великих Моголов. Успех Шах-Джахана в Декане дополнил его триумф в Меваре.