В царствование Екатерины Великой во внутренней жизни России вводились более правильное государственное устройство и порядок. Страна была разделена на губернии, и было упорядочено административное устройство. Императрица всеми силами старалась смягчить жестокий нрав своего народа, по мере сил прививать ему мысль о правосознании и порядке. Изменения, производившиеся внутри России, должны были коснуться и ее окраин – областей казачьих войск. После того как границы России были вынесены на побережье Черного моря и на Кубань, совершенно менялись роль и значение казаков, что должно было отразиться и на их внутреннем быте и условиях существования. Днепровские казаки были превращены в полки регулярной конницы, Запорожье разогнано. Правительство Екатерины стремилось распространить общие законы на все народы, входившие в состав государства. Правительство располагало достаточными средствами, чтобы произвести те же изменения в Донском Войске, какие были произведены в Днепровском. Но Донское Войско не было уничтожено, и правительственные распоряжения коснулись только его внутреннего упорядочения. Войско Донское вошло в состав Азовского генерал-губернаторства. Указом 14 февраля 1775 года город «Черкасск и все жилища верного нам Войска Донского, с соблюдением оного при всей его собственности и при всех благозаслуженных правостях зачисляются в состав Азовской губернии. Атаман Войска сохраняет власть военную и административную внутри Дона, но находится в подчинении наместника Потемкина».
В 1792 году, после произведенного размежевания донских земель и определения их границ, была издана грамота об укреплении на вечное владение занятых Войском земель и утверждена карта войсковых земель. Причины различного отношения к донским и днепровским казакам со стороны российского правительства «определялись их историческим прошлым, что выразилось в указе императрицы, в котором она писала: «Не мог и не может, конечно, быть полезен отечеству сих качеств разнообразный и юродивый состав членов Сечи, погруженных в разбойничество, праздность, гнуснейшее пьянство и презренное невежество. Их непослушание и также распространение своевольных их притязаний на земли, издревле принадлежащие нашему Войску Донскому непоколебимому в верности…»
Донские казаки на протяжении всей истории вели войны против азиатского народа и никогда не изменяли России. Отношение это было справедливо выражено членами большой комиссии 20 октября 1762 года, когда они говорили: «Предки наши Донского Войска из древних лет высокославным государям противовоюющих на Россию неприятелей оружием производили благоусердные и ревностные службы». Исторические заслуги и ценность военной силы Донского Войска побудили российское правительство не только сохранить его особенности и поставить в особые условия среди других народов империи, но идею казачества превратить в средство обороны обширных границ государства.
В Правительстве России возникла мысль о расширении казачьих войск путем образования новых казачьих областей, устраивая их как военные поселения, готовые всегда для защиты государства. Идея эта оказалась настолько соблазнительной, что привела впоследствии к уродливым аракчеевским формам «военных поселений», на организации которых строилась оборона страны. Для образования новых казачьих войск производились переселения части старых казачьих войск или же некоторые районы русского населения превращали в казаков.
Начало искусственного образования казачьих областей было положено Петром I. Он использовал для этого вначале часть населения Войска Донского, переселив тысячу семейств, образовав из них войско на Кавказе. На южных границах затем последовало образование бахмутских, чугуевских казаков, ничего общего с историей, бытом и традициями казаков не имевших. При Анне Иоанновне было выселено 1057 семей донских казаков для восстановления Волжского Войска. Но более широкое развертывание новых казачьих областей производилось в царствование Екатерины Великой. В 1770 году 517 волжских казаков были переселены в район Моздока и расселены были в пяти станицах по левому берегу Терека для усиления обороны от набегов кабардинцев. В 1777 году в состав этого полка были включены 200 кибиток крещеных калмыков, выселена была остальная часть Волжского Войска, и поселены они были в пяти новых станицах от Екатерининской до Александровской крепости. В 1755 году было утверждено Оренбургское Войско, ядром для образования которого послужили исетские казаки, утвердившиеся на р. Исети после завоевания Ермаком Сибири. В 1790 году создано было из запорожцев, возвратившихся из Турции, «черноморское войско», земли для поселения им были отведены между Днепром и Бугом. В 1792 году черноморским казакам было предложено переселиться на Кубань и занять нижнее течение реки. Черноморцы заняли территорию по реке Кубани 30 000 кв. верст и основали Екатеринодар (1794). Потом войско пополнялось переселенцами из Малороссии, и образовано было 20 полков.