В силу различных природных условий у черноморцев и линейцев сложились отличия и в отбывании воинской повинности. По прибытии на Кубань черноморские казаки практически не использовали свой флот, прославивший их в войне с Турцией. Черноморцам вменялось в обязанность охранять около 260 верст пограничной линии вдоль реки Кубани. На протяжении этой линии в короткий срок было устроено около 60 постов и более 100 пикетов. Тактика черноморцев заключалась в выслеживании противника, предупреждении набегов. Широко применяли глубокую разведку — «залоги» и «разъезды». Особенно тяжелой служба становилась зимой, когда по льду можно было беспрепятственно переправиться через Кубань. Именно у черноморцев были распространены пехотные части пластунов (от «лежать пластом») — воинов чрезвычайно искусных в партизанской войне, неожиданных засадах, воинских хитростях. Линейцы же стремились использовать преимущества конницы в степных районах — жестокими расправами стремились отбить у горцев желание к набегам. Черноморцы в важных сражениях опирались на преимущества артиллерии, линейцы больше доверяли сомкнутому строю кавалерийской атаки, которой боялись даже горцы — великолепные наездники. Черноморцы предпочитали ружья в качестве вооружения и считались лучшими стрелками на Кавказе, казака-линей-ца всегда можно было отличить по умению виртуозно владеть шашкой.
Помимо службы непосредственно на Кубани казакам приходилось выставлять полки для войн вне пределов Черномории. В 1795 г. персидские войска вторглись в Закавказье, Россия помогала единоверцам-грузинам по условиям Георгиевского трактата в отражении агрессии. В 1796 г. два полка черноморских казаков под руководством А. Головатого участвовали в так называемом Персидском походе к г. Дербенту. Казаки воевали в Молдавии и Валахии в годы русско-турецкой войны 1806–1812 гг., во время русско-иранской и русско-турецкой войн 1820-х годов — на Кавказском и Дунайском фронтах. В годы войны с наполеоновскими полчищами от Черноморского войска участвовали 1-й сводный конный полк и 9-й пеший полк (из 19 офицеров и 530 казаков домой вернулись 209 человек). На всю Россию черноморские казаки прославились в годы Крымской войны (1853–1855). За мужество, бесстрашие и отвагу казаков нередко награждали орденами и медалями, полки — штандартами и знаменами. Кроме того, казаки служили в Собственном Его Императорского Величества конвое в составе лейб-гвардейской Черноморской сотни (с 18 мая 1811 г.).
Практически на протяжении всей первой половины XIX в. в пределах Черномории имелись значительные площади свободной земли. Однако уже при переселении казачья старшина начала захватывать земельные участки, фактически находившиеся в собственности войсковых старшин. «Порядок общей пользы» (пункт 23 о выдаче «открытых листов») положил начало захвату старшиной земли в Черномории. В дальнейшем этот способ землепользования, охарактеризованный В. Н. Ратушняком как «захватный», утвердился. Но наличие огромных территорий не приводило к каким-либо осложнениям в вопросах землепользования. Обычной практикой было выселение зажиточного казака на хутор и использование в меру возможностей окрестной земли, не захваченной уже кем-либо. К середине века свободной земли уже не хватало, и зажиточные казаки стали захватывать казачьи куренные земли.
В дальнейшем произошло законодательное закрепление права пользования землей. По положению 1842 г. офицерам полагалось от 400 до 1500 десятин, нижним чинам — по 30 десятин. На самом деле к тому времени черноморские дворяне и духовенство владели гораздо большими участками.
Интенсивное использование захваченных земель было невозможно. Во-первых, на Кубани было довольно слабо развито крепостное владение крестьянами. В Черномории, например, количество крепостных крестьян по отношению к казачьему населению в период с 1810 по 1859 г. колебалось в пределах 0,5–1,5 процента. Во-вторых, на землях Черномории было запрещено селиться лицам неказачьего сословия, что приводило к отсутствию потенциальной наемной рабочей силы. Поэтому в хозяйствах казаков, даже зажиточных, земледелие в дореформенный период было крайне слабо развито. В Черномории из пригодных под пашню 2 млн десятин в 1859 г. использовалось 404 тыс. десятин, или 18 процентов.
Основной отраслью сельского хозяйства Черномории было экстенсивное скотоводство.
А на Кавказской линии практически все казаки занимались хлебопашеством, особенно на правом фланге, где опасностей набегов было меньше, а земля плодородна. К примеру, урожай на Линии в 1849 г. составил 4,5 млн пудов, или по 28,8 пуда хлеба на человека.
К 1 января 1861 г. в Кубанском войске числилось: 1 город, 152 станицы, 8 «населков», 3454 хутора, 3 крепости, 344 зимовника — всего 3962 населенных пункта. Число всех населенных пунктов войска увеличилось по сравнению с 1860 г. на 421, из них 89 станиц (21,1 %), 69 хуторов (16,4 %), 261 зимовник (62 %).