В середине марта Временный Кубанский областной гражданский комитет разослал инструкции в центры отделов о выборах гражданских комитетов, причем их проведение возлагалось на казачью администрацию. На основании «Положения об общественном управлении станиц казачьих войск» от 3 июня 1891 г. в марте — апреле прошли перевыборы станичных и хуторских атаманов. Областной съезд, проходивший в Екатеринодаре 9-18 апреля, подтвердил полномочия гражданских комитетов как органов новой власти, однако не распространил их функции на казачью территорию. Так было закреплено параллельное существование структур управления. Вместо Временного Кубанского областного исполнительного комитета на основе представительства от казаков, иногородних и горцев съезд 16 апреля избрал Кубанский областной совет из 136 человек и исполком (по два представителя от казаков и иногородних от каждого отдела и четыре от горцев).
Съезд выявил серьезные противоречия между казаками и иногородними по различным вопросам. Представители горцев выдвигали требования самоуправления Адыгеи, надеясь добиться его в союзе с казачьей верхушкой и при поддержке новой власти.
Если в России после февральской революции возникло двоевластие, то в Кубанской области возникло соотношение сил, которое генерал А. И. Деникин в «Очерках русской смуты» охарактеризовал как «троевластие». Казачьи сословные органы власти стали быстро выдвигаться на первый план. В городах области наряду с гражданскими комитетами и советами реальной силой обладали муниципальные бессословные органы управления. В таких условиях только что избранный Кубанский областной совет устранился от борьбы за всю полноту власти. Его лидеры полагали, что Совет рабочих депутатов, как и казачья Рада, — органы, выражавшие интересы соответственно рабочих и казаков, а внесословный областной совет как раз и олицетворяет демократическую власть. Но реально Кубанский областной совет так и не смог добиться желаемого.
Накануне окончания работы съезда представителей населенных пунктов и учреждений Кубани его участники-казаки объявили себя Кубанской краевой войсковой Радой, и 17 апреля теперь уже казачий съезд подтвердил создание Рады и образовал Временное Кубанское войсковое правительство, ставшие высшими органами управления войска. В состав войскового правительства вошли семь членов Кубанского областного исполнительного комитета и восемь избранных Радой представителей казачества. Войсковое правительство возглавил бывший атаман Лабинского отдела полковник А. П. Филимонов, а председателем Рады был избран Н. С. Рябовол. Рада и войсковое правительство не получили тогда широкой социальной опоры даже в среде рядового казачества. В течение мая — июня войсковое правительство было вынуждено действовать совместно с гражданскими комитетами.
В станицах власть сосредоточилась в станичных и хуторских правлениях во главе с атаманами. В отличие от городов здесь не пользовались большим авторитетом исполнительные органы, представлявшие Временное правительство, и лишь в редких случаях какой-то властью в станицах обладали исполкомы местных Советов. Обычно они действовали в одном направлении с казачьими органами. Советов казачьих депутатов на Кубани не было.
23 марта в Петрограде собрался I Всероссийский общеказачий съезд, принявший решение создать Союз казачьих войск. Постановлением съезда все земли, воды и недра на территориях казачьих областей объявлялись неприкосновенной собственностью казачьих войск. Съезд принял решение возвратить в войсковую собственность расположенные в казачьих областях земли казенные, удельные, монастырские, церковные, частновладельческие на условиях, которые предстояло выработать Учредительному собранию. Временное правительство воззванием от 3 апреля подтвердило «незыблемость исторических прав» казачества на землю. Однако, заигрывая с лидерами казачества, Временное правительство стремилось все же ограничить казачью власть, направляя правительственных комиссаров в центры казачьих областей.
В Черноморской губернии революционные события развивались иначе. 18 мая в Новороссийске одновременно открылись два съезда — I съезд рабочих, солдатских и крестьянских депутатов и съезд представителей гражданских комитетов. В ходе работы оба съезда 24 мая объединились и избрали Черноморский губернский исполнительный комитет, из состава которого был сформирован комиссариат из пяти человек. Однако абсолютного преобладания не получила ни одна политическая сила. Хотя здесь рабочая прослойка среди населения была невелика, Советы возникали в новых местах.