Имеющиеся сведения дают основание полагать, что интерес к деятельности Исследователей Библии, как первоначально назывались Свидетели Иеговы, проявился в России еще конце 1880-х гг. Так, в журнале «Сторожевая башня» за февраль 1887 г. сообщалось, что некоторое число журналов и другие публикации «Общества Сторожевой Башни» направлялись по почте в различные уголки Российской империи. В 1891 г. Ч.Т. Рассел совершил поездку в Россию, где он встречался с верующими, выступал с проповедями.
Таким образом, зародившись в США, учение Свидетелей Иеговы проникает в Россию в 1891 г. В 1913 г. представитель «Общества Сторожевой Башни» регистрирует офис на территории Российской Империи. После 1917 г. возникают устойчивые группы и собрания Исследователей Библии, налаживается распространение журнала «Сторожевая башня». С 1924 г. «Сторожевая башня» издается на русском языке, в 1929–1934 гг. на территории СССР транслируются радиолекции.
К 1940 г. число Свидетелей Иеговы резко увеличивается за счет присоединения к СССР западных территорий. Позднее учение Свидетелей Иеговы принимают сотни советских граждан, интернированных в нацистских концлагерях, где немецкие Свидетели Иеговы составляли заметную группу заключенных.
В 1946 г. собрания Свидетелей Иеговы в России посещали около 8 тыс. человек. С середины 1940-х гг. ряд Свидетелей Иеговы был приговорен к 25-летним срокам заключения по обвинению в антисоветской деятельности. В 1949 г. и 1951 г. Свидетели Иеговы и члены их семей подвергались тотальной высылке на спецпоселение в Сибирь.
В связи с репрессивной деятельностью советских властей в отношении Свидетелей Иеговы, последние образовали сеть подполья, которая осуществляла ввоз в страну образцов литературы, ее тиражирование, доставку в лагеря, организации общин и связей между ними.
После 1965 г. ограничения по спецпоселениям были сняты, часть верующих вернулась в европейскую часть СССР. До середины 1980-х гг. верующие подвергались обыскам и тюремному заключению за проповедь, распространение литературы и отказ от службы в армии. После 1996 г. репрессированные были реабилитированы Указом Президента РФ.
В 1991 г. религиозное объединение Свидетелей Иеговы было зарегистрировано в СССР. В 1999 г. Свидетели Иеговы прошли перерегистрацию. Был открыт первый Зал конгрессов на 2600 мест. Однако в 2004 г. в судебном порядке была ликвидирована община Свидетелей Иеговы в Москве. В 2010 г. Европейский суд по правам человека признал данное ограничение необоснованным и предписал восстановить общину в правах. Начиная с 2009 г. ряд изданий Свидетелей Иеговы в России был включен в список экстремистских материалов.
В настоящее время деятельность Свидетелей Иеговы в России сводится к организации проповеди в неохваченных территориях, переводу на 34 языка коренных жителей России и распространению религиозной литературы, включая Библию. Образовано более 350 религиозных групп на различных языках народов России, кроме русского. 137 групп состоят из глухих и слабослышащих, для них издаются книги, в том числе Библия, в формате видеозаписей. Строятся здания для религиозных встреч (Залы Царства). К 2013 г. их построено более 500. Ежегодно около 5 тыс. новых членов присоединяется к Свидетелям Иеговы в России, принимая крещение в среднем после трехлетнего изучения Библии и ведения соответствующего образа жизни.
Во время стихийных бедствий Свидетели Иеговы в России организуют экстренную помощь единоверцам. В 2013 г. число посещающих богослужения составило около 280 тыс. человек, из них 168 тыс. участвуют в проповеди.
Количество общин в современной России составляет 2400, в том числе 405 зарегистрированные в Министерстве юстиции РФ, из них одна централизованная и 404 местные. С 1992 г. под Санкт-Петербургом функционирует «Управленческий центр Свидетелей Иеговы в России», располагающийся в комплексе зданий на 10 га. В 2001–2010 гг. число активных последователей увеличилось на 34 %.
1990-е годы стали периодом активной работы легализованных в России и многих странах СНГ иностранных миссий и расцвета большинства протестантских общин России, включая не имевших до сих пор широкого распространения в стране, а также быстрого развития неопротестантских (харизматических, пятидесятнических) объединений. Характерными для этого периода явлениями оказались также распространение лютеранства среди традиционно не принадлежавших к нему народов бывшего СССР и появление в России ортодоксального кальвинизма.
Хотя не все протестантские объединения России ведут учет своих членов, в целом численность протестантов России составляет свыше 1 млн человек, неопротестантских объединений — свыше 200 тыс. человек.
