Однако начиная с 7 сентября допросы пошли тяжелые и утомительные, по несколько часов, как днем, так и ночью. Иногда в день к Цепкову ее водили дважды. Ночью она очень уставала, не раз впадала в дремоту, забывая задаваемые вопросы. Следователь нервничал, но не кричал, не угрожал. Ей казалось, что он с каким-то сочувствием смотрел на ее усталые глаза и утомленное лицо и иногда прекращал допросы, отправляя ее с надзирателем в камеру.
28 сентября «Монашку» разбудили в половине первого ночи. Цепков приступил к ее допросу, который длился почти до 5 часов. На следующий день, то есть 29 сентября, ее, не дав выспаться опять повели к подполковнику в 780‑й кабинет, в котором она находилась с часу ночи до 3.45. Днем 29 сентября с 14.05 до 16 часов ее опять допрашивал Цепков вместе с начальником следственной части по ОВД генерал-лейтенантом Л.Е. Влодзимирским.
Выписка из данного протокола допроса Меньшовой от 29 сентября 1945 г. была направлена заместителем наркома госбезопасности СССР Кобуловым в адрес Берии. В сопроводительной докладной записке Кобулов писал:
Всего с 1 сентября по 25 октября 1945 года Цепков вызывал «Монашку» к себе в кабинет 32 раза. 1 октября ее дважды водили к нему на допрос, в котором она подробно сообщила ему о всех известных ей фактах деятельности в 1942—1945 годах организации украинских националистов в селе Подмихайловце и монастыре Васильянок. Рассказала, как оказывала она медицинскую помощь бандеровцам, проводившим вооруженную борьбу против советских войск, а также о том, как содействовала вместе с другими монахинями укрытию раненых и разыскиваемых членов ОУН – УПА.
15 октября Б.З. Кобулов направил протокол допроса Н.И. Меньшовой от 1 октября в адрес народного комиссара госбезопасности Украинской ССР генерал-лейтенанта И.Т. Савченко. В сопроводительном письме он писал: