Все это было во времена, когда живых организмов классифицировали по их видимой анатомии, по которой бактерии гораздо менее разнообразны, чем животные или растения, и было простительно принижать их как примитивных животных и растений. Совершенно другое дело обнаружилось, когда мы начали классифицировать существ, используя гораздо более богатую информацию, предоставляемую их молекулами, и когда мы изучили спектр химических "профессий", в совершенстве освоенных микробами. Вот приблизительно как все выглядит сегодня.
Глубокие разделения жизни. Дерево жизни, на основании последних работ, показывает разделение на три основных области. Адаптировано из Gribaldo and Philippe
Если к животным и растениям относиться как к паре царств, то, согласно тем же стандартам, существуют десятки микробных "царств", чья уникальность обеспечивает им право на тот же статус, как у животных и растений. Диаграмма изображает верхушку айсберга. Не только некоторые глубоко укорененные ветви опущены, но нам представлены только те, что живут в доступных местах и могут быть выращены в лаборатории. Действительно, просто прочесывая новые места на содержание ДНК и не пытаясь определить, от каких она организмов, можно обнаружить целые новые микробные царства. Животные, растения и грибы составляют лишь три малых ветви дерева жизни. Эти три знакомых царства отличает от других то, что организмы в них крупные и построены из множества клеток. Другие царства почти полностью микробные. Почему бы нам не объединить их в одно микробное царство наравне с тремя великими многоклеточными царствами? Одна из причин, очень веская, в том, что на биохимическом уровне многие из этих микробных царств так же отличаются друг от друга и от большой тройки, как три знакомых царства друг от друга.
Было бы бесполезно детально обсуждать, существует ли "на самом деле", скажем, 20 царств на этом уровне различий, или 25, или 100. Из этой диаграммы ясно то, что эти десятки попадают в три основные сверхцарства - "домена" в терминологии Карла Везе, уже упомянутого как инициатора этого нового видения жизни. Эти три домена представляют собой, во-первых, наш собственный, эукариоты, в чьей компании мы путешествовали большую часть нашего странствия. Во-вторых, археи - микробы, встреченные нами на Рандеву 38 - которые, согласно старому представлению о жизни, были бы сгруппированы с третьим доменом, истинными (или эу-) бактериями. Именно представители этого третьего эубактериального домена встретились с нами последними в нашем паломничестве. Это почетно, делить эти последние шаги с наиболее вездесущими и эффективными распространителями ДНК, которые когда-либо существовали.
Сама звездообразная диаграмма, конечно, основана не на тех признаках, которые мы можем увидеть и потрогать. Если вы хотите сравнить организмы, вы должны выбрать черты, которые почти все они ориентировочно разделяют. Мы не можем сравнивать ноги, если у большинства видов их нет. Ноги, головы, листья, ключицы, корни, сердца, митохондрии - все это ограничивает набор существ. Но ДНК универсальна, и есть горсточка особых генов, которые все живые существа разделяют друг с другом, лишь с незначительными, единичными различиями. Они - то, что мы должны использовать для крупномасштабных сравнений. Вероятно, лучший из примеров представлен кодами, служащими для построения рибосом.