Восстание погубило себя, выйдя за пределы своих возможностей. Дворяне выступили против него, подняли свои собственные войска, объединились с войсками короля, захватили Валенсию и свергли пролетарское правительство после нескольких дней взаимной резни (1521). В разгар кризиса армия повстанцев разделилась на враждующие группы под командованием Падильи и дона Педро Хирона; Хунта также раскололась на враждебные фракции; каждая провинция продолжала свою революцию без согласования с остальными. Хирон перешел на сторону роялистов, которые отвоевали Тордесильяс и Хуану. Сокращающаяся армия Падильи была разбита при Вильяларе, а сам он был предан смерти. Когда Карл вернулся в Испанию (июль 1522 года) с 4000 немецких солдат, победа уже была одержана дворянами, а дворяне и простолюдины настолько ослабили друг друга, что он смог подчинить себе муниципалитеты и гильдии, усмирить кортесы и установить почти абсолютную монархию. Демократическое движение было настолько подавлено, что испанские простолюдины оставались трусливыми и послушными до XIX века. Карл умерил свою власть вежливостью, окружил себя вельможами и научился хорошо говорить по-испански; Испания была довольна, когда он заметил, что с женщинами следует говорить на итальянском, с врагами — на немецком, с друзьями — на французском, с Богом — на испанском.31
Только одна сила могла противостоять Карлу в Испании — церковь. Он был сторонником католицизма, но противником папства. Как и Фердинанд Католик, он стремился сделать испанскую церковь независимой от папы, и ему это удалось настолько, что во время его правления церковные назначения и доходы находились под его контролем и использовались для продвижения государственной политики. В Испании, как и во Франции, не потребовалось Реформации, чтобы подчинить церковь государству. Тем не менее, за ту половину своего правления, которую Карл провел в своем королевстве, пыл испанской ортодоксии так подействовал на него, что в последние годы его жизни ничто (кроме власти Габсбургов) не казалось ему более важным, чем подавление ереси. В то время как папы пытались умерить инквизицию, Карл поддерживал ее до самой смерти. Он был убежден, что ересь в Нидерландах ведет к хаосу и гражданской войне, и был полон решимости не допустить подобного развития событий в Испании.
При Карле испанская инквизиция ослабила свою ярость, но расширила юрисдикцию. Она взяла на себя цензуру литературы, заставила все книжные лавки обнести арками и приказала сжигать книги, обвиненные в ереси.32 Он расследовал и наказывал сексуальные извращения. Он ввел правила лимпиезы (чистоты крови), которые закрывали все пути к отличию для потомков конверсо и для всех, кто когда-либо подвергался наказанию со стороны трибунала. Сурово смотрели на мистиков, ведь некоторые из них утверждали, что их непосредственное общение с Богом освобождает их от посещения церкви, а другие придавали своим мистическим экстазам подозрительно сексуальный привкус. Светский проповедник Педро Руис де Алькарас объявил, что соитие — это действительно единение с Богом; а монах Франциско Ортис объяснил, что когда он ложится с симпатичной коллегой-мистиком — даже когда он обнимает ее обнаженное тело — это не плотский грех, а духовное наслаждение.33 Инквизиция снисходительно относилась к этим алумбрадос (просветленным), а самые суровые меры применяла к протестантам Испании.
Как и в Северной Европе, эразмианская стычка предшествовала протестантской битве. Несколько либеральных церковников приветствовали строгие замечания гуманиста по поводу недостатков духовенства; но Ксименес и другие уже успели исправить наиболее явные злоупотребления до прихода Карла. Возможно, лютеранство просочилось в Испанию благодаря немцам и фламандцам в королевском окружении. Один немец был осужден инквизицией в Валенсии в 1524 году за лютеранские симпатии; фламандский художник был приговорен к пожизненному заключению в 1528 году за сомнения в существовании чистилища и индульгенций. Франсиско де Сан Роман, первый известный испанский лютеранин, был сожжен на костре в 1542 году, а пылкие зрители пронзили его мечами. Хуан Диас из Куэнки принял кальвинизм в Женеве; его брат Альфонсо поспешил из Италии, чтобы обратить его в православие; потерпев неудачу, Альфонсо приказал убить его (1546).34 В Севилье ученый каноник собора Хуан Хиль или Эгидио был заключен в тюрьму на год за проповедь против поклонения изображениям, молитв святым и эффективности добрых дел для получения спасения; после его смерти его кости были эксгумированы и сожжены. Его соратник, каноник Константино Понсе де ла Фуэнте, продолжил свою пропаганду и умер в подземельях инквизиции. Четырнадцать последователей Константино были сожжены, в том числе четыре монаха и три женщины; многие были приговорены к различным наказаниям, а дом, в котором они собирались, был стерт с лица земли.
