Вскоре наступило время царской женитьбы. В 1647 г. по обычаю были собраны лучшие невесты, из которых отобрали шесть девиц. Царь вручил платок и кольцо дворянской дочери Афимье Всеволожской, по свидетельствам современников, красавице необыкновенной. Но Всеволожская чем-то не устроила Морозова. Существуют неясные сведения, что избранница царя была как-то связанна с врагами всемогущего боярина. Скорее всего, через этот брак противники Морозова надеялись подорвать позиции временщика. Естественно, Б. И. Морозов сделал все, чтобы избавиться от царской невесты. Пошли слухи о «порче» нареченной царевны, ее непригодности к «государевой радости». В итоге ее со всей семьей сослали в далекую Тюмень.
Расстроив одну свадьбу, Морозов принялся хлопотать о другой. Выбор боярина пал на дочерей московского дворянина Ильи Даниловича Милославского. Царю приглянулась старшая сестра, Мария Ильинична. Было объявлено о ее избрании царской невестой.
В январе 1648 г. состоялась царская свадьба. А через десять дней немолодой уже Морозов — ему шел уже 58-й год, женился на младшей сестре царицы, Анне Ильиничне Милославской. Таким образом могущественный боярин породнился
За 21 год совместной жизни Мария Ильинична родила Алексею Михайловичу 13 детей: пять царевичей и восемь царевен. Но пережили отца только 8 его детей — Евдокия (1650–1712), Марфа (1652–1707), Софья (1657–1704), Екатерина (1658–1718), Мария (1660–1723), Федор (1661–1682), Феодосия (1662–1713), Иван (1666–1696).
Между тем, уже через несколько лет ясно обнаружились результаты плохого внутреннего управления Б. И. Морозова. Морозов пытался поправить финансовое положение в государстве. Царским указом и боярским приговором 7 февраля 1646 г. была установлена новая пошлина на соль, заменившая не только прежнюю соляную пошлину, но и ямские и стрелецкие деньги, главного прямого налога страны. Она превосходила рыночную цену соли приблизительно в 1,5 раза и вызвала сильное недовольство населения. Результатом реформы явился упадок соляной торговли, резкое сокращение налоговых поступлений, невыплата жалованья стрельцам.
Соляной налог вскоре был признан мерой неудачной, и в декабре 1647 г. был издан указ, извещавший о возвращении к прежней системе налогообложения. При этом население должно было уплатить ямские и стрелецкие деньги за прежние годы. Это лишь подлило масла в огонь. В память о неудачном реформировании даже появилась присказка: «Пошли было на хлебы, да соль своротила».
К этому присоединились злоупотребления Морозова и Милославского, а также слух о пристрастии царя и правителя к иностранным обычаям. Все эти причины вызвали народный бунт в Москве и беспорядки в других городах, которые принято называть «соляным бунтом».
В мае 1648 г. Алексей Михайлович вместе с царицей отправился на богомолье в Троице-Сергиев монастырь. Между тем в столице усиливалось брожение. 1 июня толпа москвичей окружила возвращавшийся в город царский поезд с целью вручить ему петиции, о содержании которых можно только догадываться. Но вручить челобитные государю не удалось. Стрельцы разогнали народ, арестовав нескольких челобитчиков.
2 июня состоялся крестный ход, во время которого толпа окружила царя, оттеснив охрану и придворных. Самые отчаянные обвисли на узде коня, заставив Алексея Михайловича остановиться. Царь был сильно напуган таким неожиданным нападением. Он пообещал рассмотреть жалобы и наказать виновных. Схваченных накануне челобитчиков освободили. Но толпе этого показалось мало. Следом за царем москвичи ворвались в Кремль. Тогда Морозов приказал стрельцам разогнать чернь. Но неожиданно стрельцы отказались «сражаться за бояр против простого народа» и перешли на сторону восставших.
Власти вынуждены были начать переговоры. Однако парламентеров, боярина Темкина-Ростовского и окольничего Пушкина, толпа едва не разорвала. В это время в Кремле и за его пределами начались погромы дворов Морозова и его сторонников.
Во время погромов был убит думный дьяк Назарий Чистой, один из инициаторов введения соляного налога. Он пытался спрятаться у себя на чердаке в груде веников, но один холоп выдал господина. Дьяка выволокли из укрытия и растерзали. Народ стал требовать наказания самых одиозных фигур — Морозова, главы Земского приказа Л. С. Плещеева и начальника Пушкарского приказа П. Т. Траханиотова.
К восставшим вновь обратились с переговорами бояре Н. И. Романов и Я. К. Черкасский, пользовавшиеся большим уважением в народе. Между тем в Москве ширились погромы. Восставшие уже не разбирались, чьи дворы они громят. Начались пожары. Итогом переговоров стала выдача Плещеева, разъяренная толпа забила его до смерти камнями и палками. Но народ требовал Морозова и Траханиотова. Многие бояре были за то, чтобы выдать восставшим ненавистного временщика.
