Старец сам описал и пояснил духоносное событие, произошедшее с ним на 98-м году жизни, когда братия уже пришла проститься к тяжелобольному:
Немощный старец после этого собрал немалые средства на завершение строительства каменного корпуса и колокольни.
Но годы физической жизни на земле имеют свой предел. В ночь с 8 на 9 января 1902 г. служивший в Троицком соборе иеромонах, произнося ектенью, никак не мог помянуть о здравии архимандрита Ионы, что-то ему мешало. Это и было время кончины праведника.
Столетнего подвижника Иону (постриженного в схиму как Петр), «в земли Русстей чудотворца дивнаго и милостиваго», проводили в последний земной путь многочисленные почитатели.
Скажем и о последующей жизни обители. В 1918 г. монастырь чудом уцелел при мощнейшем взрыве расположенных на Зверинце складов боеприпасов. Как выяснилось потом, и саму трагедию, и спасение обители предсказывал еще сам Иона. В 1934 г. обитель была закрыта, монахи – разогнаны или репрессированы, именно тогда на территории монастыря был создан ботанический сад. После возобновления обители в 1940-х гг. она вскоре снова была упразднена.
Вспоминали, что батюшка, когда его называли мучеником, имел обыкновение ответствовать: «Нет, я после смерти буду мучеником». Странное высказывание старца разъяснилось спустя десятилетия. В 1966 г. из Троицкого храма, превращенного в склад, мощи подвижника Ионы пришлось перенести на Зверинецкое кладбище – в том же кипарисовом гробе, который святой сделал себе еще при своей жизни и в котором был упокоен. Но до этого святотатцами мощи были обезглавлены и лишены правой руки. Остались и свидетельства очевидцев, молодых сотрудников ботсада, отмечавших, что старец во гробе выглядел как только что умерший, рассказывали о его руках, белой бороде.
Возвращение в Ионинский монастырь мощей преподобного Ионы произошло осенью 1993 г., спустя два года после возобновления работы обители.
Сегодня мощи преподобного Ионы открыто почивают на прежнем месте, в склепе на правой стороне Свято-Троицкого храма. Восстановлен и расписан склеп с мощами преподобного Ионы, помещенными в белую мраморную раку, доставленную из Греции. Благостен тот, кому доводилось прикладываться к этой раке – в уютной, чудесно украшенной фресками и надписями низкой нише, расположенной в полуподвальчике под храмом.
А старый гроб подвижника выставлен в храме отдельно, в нем лежат неистлевшие погребальные облачения подвижника.
22 ноября 1995 г. решением Священного Синода УПЦ православный подвижник Иона был причислен к лику преподобных.
Зверинецкое место духовного подвижничества, изобильно украшенное в новые времена сиренево-магнолиевым цветением, несомненно, осеняется земным и небесным присутствием киевского праведника. И по его молитвам тоже Киев, быть может, еще не пал в окончательную пропасть и удерживается на краю бездны.
Бывают удивительные семьи. Иногда, пристально вглядываясь в биографии дедов, отцов, сыновей какого-либо рода, приходишь к убеждению, что в данном случае сказывается действие благодатной силы, выстраивающей сумму усилий всего рода в общем, заданном созидательном, направлении. Это неизменно восхищает, этому хочется подражать, это приводит к пониманию того, что есть высокое призвание.
Такой эффект яблок, падающих недалеко от яблони, являет собой и большая семья киевлян, род Гошкевичей, сыгравших значительную роль в духовной, культурной жизни южнорусского города Херсона, да и, как увидим, в далеких пределах.