На возражения Кондо адмирал Ямамото ответил, что план операции после тщательного изучения согласован между штабом Объединенного флота и морским генеральным штабом и не может быть изменен. Он добавил, что хотя операция и связана с некоторым риском, но если будет достигнут элемент внезапности, бояться поражения не следует. Тогда вице-адмирал Кондо повернулся к начальнику штаба Объединенного флота контр-адмиралу Угаки и спросил, известно ли штабу флота, как трудно будет обеспечить материально-техническое снабжение о. Мидуэй после его захвата. Кондо утверждал, что до тех пор, пока эта проблема не будет разрешена, захват острова бесцелен. Угаки ответил далеко не лучшим образом. Он заявил, что если снабжение оккупационных сил окажется невозможным, они будут эвакуированы сразу же после того, как уничтожат все военные сооружения. На этом дискуссия закончилась. Было ясно, что штаб Объединенного флота, несмотря на все возражения, не собирался отказываться от своего решения захватить о. Мидуэй.
Возвратившись на свой флагманский корабль, вице-адмирал Кондо передал содержание разговора начальнику штаба контр-адмиралу Сираиси и старшему офицеру штаба капитану 1 ранга Янагидзава. Последний с сожалением заметил, что Ямамото следовало согласиться хотя бы на то, чтобы силы вторжения на о. Мидуэй вышли не с о. Сайпан, а из Трука, что уменьшило бы опасность их преждевременного обнаружения. Позднее, на итоговом обсуждении плана операции, представители 2-го флота настаивали на принятии этого предложения, но безуспешно. Штаб Объединенного флота не был склонен к каким-либо изменениям плана.
В тот самый день, когда вице-адмирал Кондо изложил Ямамото свои опасения по поводу предстоящей операции, штаб Объединенного флота начал четырехдневные военные игры, целью которых была проверка запланированных, а также намечаемых операций второй фазы войны. На этих играх, проходивших на борту «Ямато» под руководством начальника штаба Объединенного флота контр-адмирала Угаки, присутствовало большинство командиров и штабных офицеров тех соединений, которые должны были принять участие в операции по захвату о. Мидуэй.
Игры начались проигрыванием вторжения на о. Мидуэй. Но это было только начало. Со времени военных игр, проведенных в ноябре 1941 года и явившихся репетицией нападения на Пирл-Харбор и операций по захвату южных районов, ни разу не проигрывалось такой большой программы наступательных действий. По предложению штаба Объединенного флота в ходе игры действия развертывались по следующему плану:
1. В первых числах июня главные силы Объединенного флота захватывают о. Мидуэй, а другие соединения флота — западную часть Алеутских островов.
2. После завершения этих операций большая часть линейных кораблей возвращается в Японию, а остальные силы вторжения на о. Мидуэй сосредоточиваются в Труке для пополнения всех видов снабжения и в начале августа начинают операции по захвату стратегических пунктов в Новой Каледонии и на островах Фиджи.
3. Соединение Нагумо наносит удары с воздуха по Сиднею и другим пунктам на юго-восточном побережье Австралии.
4. Вслед за тем соединение Нагумо, а также соединения, принимавшие участие в операциях против о. Новая Каледония и о-вов Фиджи, вновь собираются в Труке для приема топлива, а также пополнения боеприпасов и снаряжения. В начале августа при участии всех сил Объединенного флота начинаются операции против атолла Джонстон и Гавайских островов.
Кроме офицеров штаба Объединенного флота, все, кто принимал участие в военных играх, были изумлены столь обширной программой, которая, казалось, опиралась больше на фантастику, чем на реальные возможности. Еще более удивительным было то, как проводились игры. Все операции, начиная с вторжения на о. Мидуэй и Алеутские острова и кончая штурмом Джонстона и основных островов Гавайского архипелага, проигрывались на столе без малейшей запинки. Это в немалой степени объяснялось своевольным поведением контр-адмирала Угаки, который нередко просто игнорировал вводные, дававшиеся посредниками.
Например, случилось так, что соединение Нагумо подверглось удару базовой авиации противника, в то время как его самолеты вылетели для атаки о. Мидуэй. Как того требовали правила, капитан 3 ранга Окумия, офицер штаба
4- й дивизии авианосцев, выступавший в роли посредника, бросил игральные кости, чтобы определить результаты налета, и объявил, что авианосцы получили девять попаданий. В число затонувших попали «Акаги» и «Кага». Однако Угаки самовольно уменьшил число попаданий до трех, в результате чего «Кага» остался в числе «потопленных», но зато «Акаги» получил лишь «незначительные повреждения». К удивлению Окумия, даже это решение было затем отменено, и «Кага» вновь появился на следующем этапе игры, посвященном проигрыванию вторжения на Новую Каледонию и о-ва Фиджи. Решения посредников относительно результатов воздушных боев подтасовывались точно таким же образом и всегда в пользу японской стороны.