Ценность игр снижалась также тем, что офицеры штабов основных оперативных соединений, включая соединение Нагумо и 11-й воздушный флот базовой авиации, не имели времени, чтобы как следует изучить операции. В результате они выступали в роли кукол, которых дергали за веревочки офицеры штаба Объединенного флота. Недостаточность подготовки видна хотя бы из следующего инцидента, имевшего место во время проигрывания вторжения на о. Мидуэй. Некоторая опрометчивость, с которой действовало соединение Нагумо, вызвала ряд критических замечаний. Был задан вопрос: какой план действий будет принят, если на фланге соединения появятся авианосцы противника, в то время как оно будет атаковать о. Мидуэй с воздуха. Ответ офицера штаба соединения Нагумо был настолько туманным, что само собой напрашивалось предположение об отсутствии такого плана вообще, и контр-адмирал Угаки лично указал на необходимость тщательно продумать этот вопрос. Как мы узнаем, именно так все и произошло в ходе самого сражения.
4 мая военные игры закончились. Следующие два дня были посвящены разбору игр и заключительным совещаниям. Целый ряд предложений, внесенных в ходе обсуждения и предусматривавших некоторые изменения плана операции, был отвергнут. Почти все командующие флотов и соединений, особенно вице-адмирал Кондо, энергично настаивали на отсрочке операции, чтобы иметь больше времени на подготовку. Но контр-адмирал Угаки утверждал, что такой вариант исключен, так как подобная отсрочка, если только не отложить операцию на целый месяц, означает, что майеврирование в районе высадки десанта придется производить при неблагоприятной фазе луны.
В эти же дни штаб соединения Нагумо доложил, что радиооборудование на флагманском корабле «Акаги» не отвечает предъявляемым к нему требованиям. Это относилось, собственно, ко всем авианосцам. Дело в том, что авианосцы должны были иметь низкие радиомачты, которые не мешали бы взлету и посадке самолетов. Начальник штаба соединения Нагумо контр-адмирал Кусака на совещаниях неоднократно указывал, что «Акаги», вероятно, будет не в состоянии перехватить радиограммы противника, которые могут оказаться чрезвычайно важными для правильной оценки обстановки и намерений противника. По этому вопросу было выдвинуто два предложения. Согласно первому, «Ямато», флагманский корабль адмирала Ямамото, вместо того чтобы возглавлять главные силы линейных кораблей, что потребовало бы соблюдения радиомолчания, должен действовать независимо от них, и все важнейшие сведения, полученные в результате радиоперехвата, передавать соединению Нагумо. Согласно второму, «Ямато» должен действовать совместно с авианосцами. В этом случае адмиралу Ямамото следовало принять на себя непосредственное командование Ударным авианосным соединением Нагумо.
Ни одно из этих предложений принято не было.
Это один из примеров того, что в плане операции не предусматривалось оказание достаточной поддержки соединению Нагумо. При ведении воздушной разведки соединение могло рассчитывать только на свои самолеты. Из-за недостатка кораблей охранения, которые могли бы обеспечить эффективный заградительный зенитный огонь, соединение Нагумо при воздушных атаках должно было полагаться в основном на собственный боевой воздушный патруль. Ясно, что линейные корабли, которые должны были находиться в 300 милях к западу от авианосных сил, не могли оказать какую-либо помощь авианосцам, в случае если последние подвергнутся нападению. Вне всякого сомнения, офицеры штаба Нагумо не представляли себе, каким образом наши линейные корабли, находясь в таком глубоком тылу, смогут принести хоть какую-нибудь пользу в операции.
Вся беда была в том, что, как уже указывалось ранее, составители плана исходили из устаревшей, но все еще господствовавшей в штабе Объединенного флота концепции. Сторонники ее утверждали, что главная сила флота не авианосцы, а линейные корабли. Вместо того чтобы использовать линейные корабли для прикрытия и поддержки авианосцев, наоборот, сами авианосцы должны были поддерживать и прикрывать линейные корабли. Командованию Объединенного флота предстояло убедиться в порочности этой концепции, и к тому же при самых трагических обстоятельствах.