Рассерженный Борис приказал отвезти Марфу обратно и содержать еще в большей строгости. Причиной его бурного негодования было то, что 16 октября названный Дмитрий вступил в пределы Московского государства. Его войско состояло из наемных белорусов, украинцев, поляков, казаков и постоянно росло. Не только простые люди, но и служилые переходили на сторону Дмитрия, один за другим ему сдавались русские города.
Царское войско под командованием Басманова отбило Дмитрия от Новгород-Северска, но войско Мстиславского потерпело поражение. 21 января 1605 г. Дмитрий потерпел поражение от войска под командованием Мстиславского и Шуйского и отступил в Путивль, куда со всех концов Руси стекались русские люди «бить челом своєму прирожденному государю». Имя Гришки Отрепьева вызывало у них смех.
Годунов находился в сильном расстройстве. Он стал обращаться к ворожеям, разным предсказателям, выслушивал двусмысленные прорицания, запирался в покоях и целыми днями сидел в полном одиночестве. Своего сына он отправлял молиться по церквам. Даже в самых близких людях он подозревал изменников и уже не надеялся справиться с названным Дмитрием военными силами, а после неудачной попытки отравить его и вовсе пал духом.
13 апреля 1605 г. с утра царь Борис был здоров и казался веселее обычного. После обедни по случаю недели Мироносиц был приготовлен праздничный стол в Золотой палате. Годунов ел с большим аппетитом, а затем поднялся на вышку, с которой любил обозревать Москву. Вскоре он поспешно спустился оттуда и сказал, что чувствует озноб и дурноту.
Побежали за доктором. Пока тот пришел, у Бориса из ушей и носа пошла кровь. Царь потерял сознание. Прибежал патриарх Иов и духовенство, наскоро причастили царя, совершили пострижение и нарекли Боголепом.
В три часа дня Борис Годунов умер. Целые сутки приближенные боялись объявлять народу о кончине царя. Только на следующий день стали посылать народ в Кремль целовать крест на верность царице Марии и ее сыну Федору. Патриарх Иов объявил, что именно им царь завещал престол, а по Москве пошел слух, что Годунов в отчаянии своего безнадежного положения сам себя отравил.
На следующий день Годунова похоронили в Архангельском соборе рядом с предыдущими правителями Московского государства. Новым царем стал его 16-летний сын Федор Годунов — полный, румяный, черноглазый и, как говорили современники, «изучен всякого философского естествословия».
В Москве ему присягали безропотно, но тут же говорили: «Недолго царствовать Борисовым детям! Вот Дмитрий Иванович придет в Москву».
17 апреля главным воеводой царского войска был назначен Петр Басманов, которому Борис Годунов перед смертью больше остальных доверял. Вместе с ним был князь Катырев-Ростовский. Мстиславского и Шуйского отозвали в Москву.
Для приведения армии к присяге на верность Федору Годунову в войско приехал митрополит Исидор с духовенством, однако на построении вдруг поднялся шум.
«Мы знаем одного законного государя — Дмитрия Ивановича!» — первыми закричали рязанские дворяне Ляпуновы.
Заодно с ними выступили все рязанцы, к которым тут же присоединились служилые люди украинских городов. В конце концов имя Дмитрия Ивановича заглушило имя Федора Борисовича Годунова, и митрополит с духовенством поспешили убраться подальше.
Петр Басманов написал на имя Дмитрия покаянное письмо и отправил с гонцом, а сам собрал воевод — братьев Василия и Ивана Голицыных, Михаила Салтыкова — и объявил, что признает Дмитрия настоящим государем.
«Все государство Русское приложится к Димитрию, и мы все-таки поневоле покоримся ему и тогда будем у него последними, — сказал он им. — Так лучше покоримся ему, пока время, по доброй воле и будем у него в чести».
Братья Голицыны и Салтыков согласились с ним, но никто из них не решался объявить о своем решении войску.
«Я присягал Борисову сыну, совесть зазрит переходить по доброй воле к Димитрию Ивановичу; а вы свяжите меня и ведите, как будто неволей», — сказал Василий Голицын.
Наконец 7 мая 1605 г. Петр Басманов построил войска и объявил, что признает Дмитрия Ивановича законным наследником Русской земли. Армия ответила одобрительным ропотом. Тогда священники стали приводить войска к присяге на имя Дмитрия Ивановича. Князья Катырев-Ростовский и Телятевский отказались принимать присягу и бежали в Москву.
Когда в столице узнали о переходе армии на сторону Дмитрия, в городе несколько дней царила глубокая тишина. На иностранцев она наводила почти панический ужас: она была похожа на затишье, которое бывает в природе перед страшной бурей.
1 июня 1605 г. дворяне Плещеев и Пушкин привезли от Дмитрия грамоту. Узнав об этом, народ толпами повалил в Красное село, где они остановились, подхватил гонцов и повез на Красную площадь. Ударили в колокола. Посланцев поставили на Лобном месте. На Красной площади была невообразимая давка.
Вышедшие из Кремля думные люди закричали: «Что это за сборище, берите воровских посланцев, ведите в Кремль!»
