По неполным данным, в ходе восстания и последовавшей расправы было убито 1059 человек (в том числе 137 женщин и 86 детей). Потери со стороны властей – 36 полицейских и 28 воинских чинов, 78 раненых. Сотни рабочих были арестованы, несколько тысяч уволены. С разгромом восстания РСДРП и другие революционные партии были вынуждены заново искать «твёрдую почву» под ногами.
В декабре 1905 – январе 1906 года восстания произошли в нескольких городах и регионах страны: Новороссийске, Ростове-на-Дону, Чите, Донбассе, Владивостоке и др. Везде Советы и рабочие дружины на короткое время брали власть и провозглашали республику, но затем подходили воинские части и подавляли восстание. В декабре было казнено без суда 376 человек. Поражение декабрьских восстаний привело к значительному ослаблению революционных партий и их авторитета. Но они оказали воздействие на самодержавие – в разгар Московского восстания были приняты законы, которые закрепляли и конкретизировали положения Манифеста 17 октября.
Осень 1905 года в Сибири выдалась неспокойной. Регион сполна испытал на себе последствия Русско-японской войны, выразившиеся в продовольственном, жилищном и топливном кризисах. На этой почве набирали силу оппозиционные движения. Политическая активность населения начала проявляться в митингах и забастовках, а с момента опубликования Высочайшего манифеста 17 октября 1905 года об усовершенствовании государственного порядка – в виде организаций боевых дружин и вооружённых отрядов самообороны. Дошло до терактов против представителей власти в Красноярске и Иркутске.
К декабрю власть в городах находилась в руках местных дум, на линии Сибирской и Забайкальской железной дороги революционные организации фактически установили свои порядки. К концу месяца положение властей было настолько отчаянным, что начальник Иркутского губернского жандармского управления М. Л. Гаврилов телеграфировал директору департамента полиции, что «фактически полиции не существует… Административной гражданской власти нет».
Для решения «сибирских» проблем император Николай II выбрал генерал-лейтенанта Павла Карловича фон Ренненкампфа, уже зарекомендовавшего себя человеком деятельным и решительным. Император завершил свой приказ словами: «Я и Россия ожидаем от него энергичной деятельности». Оправдывая надежды императора, Павел Карлович в кратчайшие сроки приступил к наведению порядка на Забайкальской железной дороге. 9 января 1906 года он с созданным им специальным отрядом на двух поездах выдвинулся на станцию Маньчжурия, где предал революционеров военно-полевому суду. И тут же получил прозвище «вешатель».
Осторожно продвигаясь на запад, отряд восстанавливал работу телеграфного, железнодорожного сообщения и наводил административный порядок. Вечером 22 января поезд прибыл в Читу. Накануне генерал отправил сообщение о разоружении города и был готов приступить к самым решительным мерам при оказании сопротивления, но, как докладывал сам Ренненкампф, «обошлось без кровопролития». В общей сложности было арестовано около 250 участников революционных выступлений, многие из них были осуждены.
Принятые меры принесли плоды: железнодорожное сообщение было восстановлено, созданная революционерами Читинская республика ликвидирована, тем самым было обезглавлено революционное движение в Забайкалье. Именно за эти результаты П. К. Ренненкампф был приговорён Сибирским союзом партии социалистов-революционеров к смерти.
Для приведения приговора в исполнение при Иркутском комитете партии социалистов-революционеров была создана боевая организация. Но вовремя полученные начальником Иркутского губернского жандармского управления агентурные сведения позволили ликвидировать террористическую группу ещё до прибытия П. К. Ренненкампфа в город. Было арестовано 23 человека, обнаружены оружие и самодельная бомба, предназначавшаяся для покушения.
Позже, при попытке побега из Иркутского тюремного замка, часть обвиняемых погибла, другая по приговору суда была расстреляна. Удалось бежать только четырём членам террористической организации, однако восстановить её работу они уже не могли. Как указывал прокурор Иркутской судебной палаты Е. П. Нимандер, «ряд арестов настолько ослабил местную организацию, что… до конца 1906 года внешних проявлений деятельности социалистов-революционеров не замечалось».
Ренненкампф 15 сентября 1906 года прибыл в Иркутск и вступил в командование III Сибирским армейским корпусом. Казалось бы, можно было не опасаться угроз, однако всего предусмотреть не удалось.