Судьба запорожских казаков, остававшихся с Мазепой до конца, не погибших в сражении под Полтавой и во время последующего бегства, была незавидной. Они были вынуждены порвать всякие связи с родными местами, где их могли опознать, поймать и предать суду за государственную измену. Поэтому эти казаки рассеялись по рекам и морским заливам, превратившись в бродяг и разбойников. Отдельные же пошли еще дальше — бежали за рубеж, предложив свою саблю врагам России. В частности, запорожец Иван Григорьев, выходец с Левобережья Днепра, схваченный в Малороссии весной 1713 года, был «пытан и огнем зжен», после чего сообщил, что он после поражения под Полтавой бежал в Крым, где поступил на службу к хану и уже как лазутчик был направлен обратно на Украину.
О трагической судьбе этих людей вскоре после 1709 года в своих стихах малороссиянин Феофан (Прокопович) писал (перевод мой. —
В мае 1710 года остатки Запорожского казачьего войска, находясь в Бендерах, уже в эмиграции избрали своим гетманом Филиппа Орлика — «самого верного соратника Мазепы». 5 мая того же года он огласил текст Пакта и Конституции прав и вольностей Запорожского Войска, которую украинские историки-националисты считают первой конституцией «независимой» Украины. В ней провозглашалась независимость Украины как от России, так и от Речи Посполитой, обозначались границы этого «государства» в соответствии с Зборовским договором 1649 года и обусловливался союз со шведским королем и крымским ханом.
В январе 1711 года Ф. Орлик со своими запорожцами, вместе с крымскими татарами, вторгся на территорию Молороссии, но, потерпев ряд поражений, эмигрировал в Европу, где впоследствии скитался по правящим дворам Германии, Польши, Франции, Турции, стремясь уговорить их правительства начать борьбу за освобождение земель, населенных украинцами с целью создания там государства. Не добившись этого, он умер на чужбине в 1742 году и был похоронен в Яссах в Румынии.
Вскоре после Полтавской битвы, 17 июля 1909 года гетман Иван Скоропадский подал царю статьи о Малороссии. Он просил об «утверждении прав, вольностей и порядков, доселе бывших в малороссийском войске, о том, чтобы великороссийские воеводы не вмешивались в городские и полковые дела, а присматривали бы только «за замками», расправы без малороссийской старшины сами не чинили, чтобы выведены были гарнизоны, помещенные в некоторых малороссийских городах». Также он просил, «чтобы гетману слушаться одного только государя, указы получать только от его имени».
В качестве ответа на эти просьбы в январе 1710 года в Киев от московского правительства был назначен наместник-воевода князь Д.М. Голицын. В Глухове, в окружении гетмана, учреждалась должность «государева министра», особого чиновника, который должен был отвечать перед правительством за благонадёжность гетмана и участвовать вместе с ним в управлении. Первым таким «государевым министром» был назначен суздальский наместник А.П. Измайлов. Ему даны были в распоряжение великорусские полки, которые раньше находились при Мазепе.
Измайлов, заняв свой пост, занимал его очень не долго. В сентябре того же 1710 года он должен был оставить свой пост, потому что сделал один опрометчивый поступок, подписав вместе с гетманом увещательную грамоту к запорожцам, среди которых начались волнения и беспорядки. Гетман, узнав, что Измайлова хотят сменить, просил тогдашнего канцлера Головкина оставить его на прежнем месте, но Измайлов все же был отозван, а на его место были назначены два чиновника: думный дьяк Виниус и стольник Федор Протасьев.
