Евгений рос в аристократическом доме своей бабки, которая готовила физически слабого и некрасивого внука к церковной карьере. Однако тот мечтал о карьере военного и, повзрослев, обратился к королю Людовику XIV с просьбой о вступлении в ряды французской армии. Однако монарх отклонил его просьбу, не желая пополнять ряды королевской армии детьми заговорщиков.
Избрав для себя военную карьеру, Евгений Савойский уехал из Парижа в Австрию. В 1683 году он поступил волонтёром в австрийскую императорскую армию. В то время Вена воевала с Оттоманской Портой и охотно принимала в австрийскую армию любых волонтёров.
Впервые молодой Евгений Савойский отличился в большом сражении с турками под стенами Вены, которую они осаждали с 14 июля 1683 года. Он служил в 70-тысячной армии христиан-европейцев под командованием польского короля Яна III Собеского, пришедшего на помощь осаждённой Вене. 12 сентября близ австрийской столицы произошло сражение со 158-тысячной турецкой армией, которой командовал Кара-Мустафа-паша.
Польский король первым атаковал позиции османов и после ожесточённого боя, длившегося весь день, разгромил турок, которые понесли значительные потери. На поле битвы пали шесть султанских генералов-пашей. Сам Кара-Мустафа-паша счастливо избежал плена, бежав из-под Вены в свои пределы. Столица Австрии была спасена.
После этого Евгений Савойский принимал участие в освобождении Венгрии от турецких войск в 1684-1688 годах. В этой австро-турецкой войне Евгений Савойский одержал свои первые победы.
Затем последовало участие в войне Большого союза 1688-1697 годов за Английское наследство. Однако здесь герцога Евгения Савойского ожидало поражение, которое он понёс 4 октября 1693 года в сражении при Марсальи, где он командовал объединёнными силами австрийцев, испанцев и англичан. В тот день союзники, имевшие перевес в силах, были атакованы французской армией под командованием маршала де Катина и после ожесточённого боя отступили за реку. В сражении только одни австрийцы потеряли убитыми около 6 тысяч солдат. Победители же потеряли намного меньше людей.
Однако это поражение полководец полностью перечеркнул блестящей победой над турецкой армией под командованием великого визиря Ильяса Мехмеда при Зенте 11 сентября 1697 года. Евгений Савойский во главе австрийских войск после 10-часового марша подошёл к реке Зенте, в то время когда султанская кавалерия уже форсировала реку, а пехота переходила её по мосту. Великий визирь в походе на Трансильванию был застигнут врасплох.
Австрийцы подходили к реке, укрываясь за холмами. Перед самой Зентой они решительно атаковали турок, расчленили их пехоту на две части, разбили её и загнали в реку. После этого началось истребление османского войска. В ходе этого продолжительного сражения турки потеряли (по разным сведениям) от 20 до 29 тысяч человек, австрийцы же — всего 500 человек.
Победа над турецкой армией при Зенте выдвинула принца Евгения Савойского в число лучших европейских полководцев. В 1697 году он стал генералиссимусом Австрии. Победа на берегах Зенты способствовала заключению выгодного для Вены Карловацкого мира.
Евгений Савойский сражался с самыми разными противниками, был союзником или врагом большинства крупнейших полководцев Европы того времени. В этом отношении показательна война за Испанское наследство 1701-1714 годов.
В июле 1701 года австрийские войска под его командованием в сражении при Карпи в итальянской Ломбардии нанесли поражение французским войскам под командованием маршала де Катина. Французы потерпели полное поражение, после которого их полководец был отстранён от командования. Так Евгений Савойский отплатил маршалу за поражение при Марсальи. В том же году он одержал ещё одну победу — при городе Кьяри. После двухчасового сражения неприятель (в лице французов и испанцев), потеряв 3 тысячи человек, отступил, а австрийцы обошлись потерями в 117 человек.
В следующем году Евгений Савойский неожиданно атаковал город Кремону с сильным французским гарнизоном. Защитники Кремоны не успели даже подать сигнал тревоги, и многие французские военачальники, в том числе и маршал Вильруа, попали в плен. Часть гарнизона укрепилась в цитадели. Австрийцы не стали её штурмовать, поскольку получили известие о приближении больших сил неприятеля, спешивших на выручку гарнизону Кремоны, и отступили.