Подводя итог анализу действий сил и войск эскадры в Адриатическом море, следует отметить, что, практически, до самого конца они были совместными русско-турецкими с участием восставшего местного населения. По продолжительности эти действия составили около года и трех месяцев. За это время пришлось дважды развертывать силы и войска, блокировать в течение 69 суток одну из сильнейших крепостей, устраивать жизнь в освобожденных городах и населенных пунктах. Характерными особенностями действий русско-турецких сил и войск были одновременные атаки крепостей с суши и моря, устройство артиллерийских батарей на берегу, храбрость офицеров и солдат, вера в свою силу и превосходство над противником. Базирование кораблей осуществлялось, в основном, в освобожденных портах вблизи Анконы (Пьезаро, Сенигаллия), снабжение – из местных ресурсов, снаряды, порох – из запасов кораблей. Малое количество десантных войск по сравнению с численностью австрийских войск послужило тому, что австрийцы подписали капитуляцию крепости без русских и турок. Ф.Ф. Ушаков не имел информации, да и необходимых сил и войск, чтобы переломить ситуацию под Анконой в свою пользу.
Как отмечалось выше, русские войска совместно с неаполитанскими нерегулярными частями вошли в предместья Неаполя 9 июня. С ходу были взяты две из трех крепостей. Однако третья крепость Сант-Эльма продолжала обороняться. С командованием крепости велись переговоры о сдаче. В переговорах участвовали неаполитанцы, русские и англичане. Вскоре капитуляция была подписана. В соответствии с условиями капитуляции французы и сочувствующие им лица («якобинцы»), которых было много в столице Королевства могли покинуть страну. Во время оккупации в Королевстве и особенно в его столице, по существу, бушевала гражданская война и был разгул преступности. Поэтому многие боялись возвращения законной власти. Для вывоза их в Тулон предоставлялись суда. Первая партия войск и беженцев была отправлена из города. То есть условия капитуляции, в которой участвовали русские, уже начали действовать. Но тут резко изменились обстоятельства.
12 июня к Неаполю прибыла англо – португальская эскадра под командованием Г. Нельсона (18 кораблей) и высадила на берег около 3 тысяч человек. Он объявил подписанную ранее капитуляцию недействительной, поскольку она не ратифицирована королем, который и уполномочил адмирала дезавуировать подписанный документ. Многие исследователи относят этот факт к позорным, справоцированным коварной леди Гамильтон – любовницей Нельсона. Тут же в городе начался жестокий террор. Утверждают, будто, по улицам кровь текла рекой, казнили и якобинцев и бандитов и многих невинных. Естественно, ответственность за эту акцию возлагают на Нельсона.
Не успевшие выехать французы вновь стали обороняться в удерживаемой крепости. Осада её осуществлялась совместно англичанами, португальцами, неаполитанцами и русскими.
Русский отряд действовал с одной стороны крепости, построив две батареи для обстрела крепости. Обстрел продолжался 25–29 июня. Аналогично с других сторон действовали англичане и португальцы. Неприятель вывесил белый флаг. Из состава русского отряда отличились: лейтенант Снискарев, мичманы Викорст, Никифоров, Карачинский, констапель Туянм и др.
Однако от подписания капитуляции русские были отстранены. Победу присвоили себе сильнейшие англичане и неаполитанцы. У них в данном районе было больше не только войск, но и было полное господство на море.
Следующей крепостью, которую предстояло взять была крепость Капуя. 8 июля отряд капитана 2 ранга Г.Г. Белле отправился для осады этой крепости вместе с английскими, португальскими и неаполитанскими войсками. 10-го прибыли на место и к 13-му развернули две батареи. Обстрел крепости непрерывно осуществлялся до 16 июля. На следующий день «крепость взята на капитуляцию», гарнизон отправлен в Тулон. Точно также, как и ранее, от победы русские были отстранены.
Близлежащая крепость Гаэта сдалась без боя неаполитанским войскам. После этого с 29 августа Королевство Обеих Сицилий считалось освобожденным. На очереди было изгнание французов из провинций северной Италии. В Папской области оставались три места занятые французами: Кастель-Сент-Анжело, Анкона, Чивита-Веккия. К концу июля Чивита-Веккия находилась в блокаде жителей, а со стороны моря – мелких неаполитанских судов из Неаполя, а также английских фрегата и брига.