Это обличение указывает на то, что, кроме невежества, духовенство далеко не отличалось теми нравственными качествами и смиренномудрием, которые характеризовали монахов первых времен христианства на Руси. Иоанн Вишенский укоряет русских архиереев, архимандритов и игуменов за то, что они отнимают волов и лошадей у бедных поселян, выдирают от них денежные дани, дани пота и труда, высасывают кровь из бедняков, а сами живут в роскоши, наряжаются и наряжают слуг своих, в то время как у бедных подданных нет и сермяжки, чтобы прикрыть наготу свою. Все это, конечно, относилось к высшему духовенству из дворян, которое тянулось за роскошной и привольной жизнью своих родичей шляхтичей и так же, как шляхтичи, выжимало соки из крестьян своих поместий. Состояние же низшего духовенства было порой не менее плачевно, чем состояние подневольных холопов. Владыки обращались с священниками и другими духовными лицами грубо, облагали их налогами в свою пользу, наказывали тюремным заключением и побоями, не давая никому отчета. Паны также угнетали священников, наравне с холопами. Но особенно плохо жилось низшему духовенству там, где пан был католик или протестант. Каждое богослужение оплачивалось тогда пошлинами в пользу пана. Иногда русские шляхтичи, обратившись в протестантство, из усердия уничтожали церковь, а здание, где она находилась, обращали в хлев.
В 1590 году митрополит созвал в Бресте собор для совещания о беспорядках православной церкви. На этом соборе было указано, как на одну из причин неурядицы, на подчинение константинопольского патриарха турецкой власти. Епископы признавали тягость такой зависимости православной церкви и высказывали пожелание соединения ее с католической. После обсуждений решено было выразить письменно это желание признать власть римского первосвященника, при условии полного сохранения церковного устава восточной церкви. Митрополит из осторожности отклонился от участия в составлении такого документа. Иезуиты долго увещали его. Они говорили ему о великой чести восседать в соборах рядом с первым лицом католического духовенства. Затем они увещали его не обращать внимания на упрямство неразумной черни или некоторых лиц из родовитого духовенства, остающихся верными власти греческого патриарха. Таких они советовали удалять и заменять их простыми людьми, на которых можно легче воздействовать. Рекомендовали также облагать большими поборами, отсылать подальше упорных, оказывающих влияние на других, не допускать сходок и общих рассуждений, карать ослушников тюрьмою и другими наказаниями. Советовали особенную осторожность в отношении прихожан, чтобы не давать им никакого повода к неудовольствию, ни в каком случае не изменять ничего в обрядах и только исподволь подготовлять почву к соединению церквей. Слово уния, которого так боятся православные, должно быть совершенно изъято из обращения. Следует остерегать православных от общения с протестантами.
Более всего препятствовали всем таким посягательствам на власть константинопольского патриарха распространявшиеся повсюду братства. В членах братства патриархи имели верных друзей и помощников в наблюдении над высшими духовными лицами, что особенно раздражало последних. Они искали сочувствия у русской и литовской православной аристократии. Князь Острожский начинал уже склоняться в пользу унии, но только в том случае, если на нее согласится вся православная церковь, а не только русская. Он советовал митрополиту поговорить с московским патриархом и государем. На это митрополит не согласился. Вообще духовенство прибегало ко всяким хитростям и даже обманам, опасаясь идти прямым путем к своим целям. Обращение епископов к королю имело полный успех. Выслушав заявление, он пожелал, чтобы к нему примкнула вся западно-русская церковь и чтобы все владыки гласно засвидетельствовали свое согласие подчиниться папе. После этого несколько лет шла работа над окончательной формой унии для представления королю и папе. Влиятельные лица русского общества и духовенства участвовали в этой работе. Константин Острожский, бывший тогда киевским воеводой, оказал сильный протест проведению унии таким способом. Он написал послание ко всем христианам, называя епископов волками и злодеями и убеждая единоверцев стоять непоколебимо в отеческой вере. Он изъявлял даже готовность выставить собственное войско на защиту православия. Послание произвело сильное впечатление на многих православных шляхтичей, духовных лиц и горожан. Король встревожился и думал повременить
