Между тем в России свершилась вторая за год революция. Труфанов решил вернуться на родину. В 1918 г. он появился в Царицыне, к изумлению и радости своих приверженцев. По некоторым сведениям, он собирался предать проклятию большевиков, а Троцкого провозгласить Антихристом. Но он быстро изменил свое намерение и вступил на путь сотрудничества с новой властью. Вероятно, ему импонировала большевистская политика, направленная на уничтожение эксплуататорских классов. Он заявлял: «К Октябрьской революции отношусь сочувственно, ибо после Февральской революции остались помещики, купцы и фабриканты, которые пили народную кровь». Когда Царицын заняли белые, Труфанов бежал в Москву, а после победы большевиков в Гражданской войне вновь вернулся в Царицын и с разрешения революционных властей занял часть помещений Свято-Духовского монастыря.
Труфанов рассчитывал, что церковь порвет со своим прошлым, и мечтал приблизить ее к простому народу. Подобные планы вынашивали также некоторые другие представители православного духовенства, принявшие участие в так называемом движении обновленцев. Советская власть поддерживала обновленцев, но, по мнению чекистов, им не хватало пролетарской твердости. В декабре 1920 г. заведующий отделом ВЧК Самсонов докладывал Ф.Э. Дзержинскому: «Даже такой решительный и смелый вояка в рясе, как Илиодор Труфанов, даже он в паутине Церкви не нашел присутствия духа для того, чтобы открыто ударить церковной иерархии прямо в лоб»668. Вопреки пессимизму чекистов Т^уфа-нов решился на активные действия. На Пасху 1921 г. он объявил об основании им «Живой христовой церкви» и самолично рукоположил себя в епископы Царицынские и патриархи всея Руси. Свое служение патриарх Илиодор начал с провозглашения «многая лета» большевистским вождям: «Вы, опередившие толпу на три поколения, рейте кверху сквозь тучи и молнии, через широкие моря в светлое царство благословенного социализма». О выступлении патриарха Илиодора с одобрением отозвался Емельян Ярославский: «...Чрезвычайно интересная речь Илиодора, которая отражает настроения определенной части народных низов»669670671.
В.И. Ленину было известно имя Илиодора. В период эмиграции он неоднократно упоминал о нем в своих статьях как о мракобесе и черносотенце. На обращение Илиодора глава советского правительства не ответил, возможно, даже не прочитал. Точно известно, что письмо дошло до приемной Совнаркома. Из приемной копию направили в Наркомат юстиции, который, в свою очередь, запросил Царицын о характере и размерах движения Илиодора. Председатель Царицынской губчека в своем ответе отметил: «В сущности, никакого движения массового нет».
У Илиодора оставались верные поклонники, которых в декабре 1921 г. запечатлели на пленке операторы, снимавшие по заказу АРА. Американская организация занималась помощью голодающим Поволжья и имела некоторую свободу рук в большевистской России. Американцы, хорошо помнившие Безумного монаха, посетили Царицын и были глубоко впечатлены рождественской службой в монастырском храме. Документальный фильм о русской миссии АРА был показан в кинотеатрах США, он включал съемку Илиодора, его жены и двоих детей. Панорама показала Илиодора среди толпы последователей. Сопровождающий текст назвал Свято-Духов монастырь «Коммуной вечного мира».