Двухкомпонентное топливо нового двигателя состояло из окислителя, так называемого «состава Т» – 80 % перекиси водорода, и горючего – «состава С», смеси гидразингидрата и метанола.
Однако после самоубийства Э. Удета в ноябре 1941 года сменивший его Э. Мильх снизил приоритетность ряда программ, которым уделял особое внимание его предшественник. В числе их оказался и ракетный перехватчик. Не особо был заинтересован в «чужом» проекте и Мессершмитт, с которым Липпиш расстался в мае 1943 года (по некоторым данным, рассматривался даже вариант смены названия проекта на Li-163S). К тому же гораздо медленнее желаемого продвигалась и работа над усовершенствованным двигателем – только в июне 1943 года Липпиш получил первый R-II-211. Серийный же выпуск фактически начался лишь весной 1944 года. Скорость серийного боевого самолета равнялась 955 км/ч, скороподъемность – 80 м/с, потолок – 12 000 м.
Однако Ме.163, получивший собственное имя «Комета» (нем. Komet), не стал настолько грозным оружием, как ожидалось. Изначально предполагалось, что запаса топлива будет хватать на достижение в течение 3 минут высоты 12 000 м на максимальной тяге и тридцатиминутного полета на пониженной тяге, что позволило бы иметь радиус действия порядка 240 км. Однако на практике расход топлива оказался гораздо выше расчетного, и фактически горючего хватало не более чем на 8—12 минут полета. Малая продолжительность полета ограничивала радиус действия перехватчиков до 100 км и требовала поражения цели фактически с одного захода – на повторную атаку могло просто не хватить горючего. При этом достаточно непростой задачей являлось управление тягой двигателя, в результате на высокой скорости перехватчики, располагая фактически всего пятью-четырьмя секундами на прицеливание и открытие огня, просто проскакивали мимо цели, а при атаке с небольшой скоростью становились легкой добычей прикрывающих бомбардировщики истребителей. Оставляла желать лучшего и устойчивость в полете.
Встречи Me.163В с авиацией противника состоялись в конце июня 1944 года, но первая воздушная победа «кометы» была зафиксирована только 16 июля – был уничтожен американский бомбардировщик B-17 «Flying Fortress», при этом один реактивный перехватчик был сбит истребителями сопровождения, еще один записали на свой счет бортстрелки бомбардировщиков.
Всего до конца войны пилоты группы II./JG 400, в основном принимавшей участие в боевых действиях, сбили, по имеющимся данным, 9 самолетов противника, недосчитавшись 14 своих машин (причем только 5 из них относилось к боевым потерям). В целом количество аварий и катастроф ракетных истребителей было крайне высоко – из выпущенных, по разным данным, от 320 до 350 самолетов (из которых на вооружение люфтваффе поступило около 280) в руки союзников по окончании боевых действий попало примерно 80 машин.
До последних дней велась работа и над совершенствованием машины, причем в первую очередь усилия были направлены на увеличение продолжительности полета. Результатом этого стало появление сперва Me.163С, оснащенного двигателем HWK 509C-1 с дополнительной камерой сгорания, что подняло тягу с 1700 до 2000 кгс, и увеличенным объемом топливных баков, а затем Me.163D (или Me.263). Последний, помимо нового увеличенного фюзеляжа с герметичной кабиной, получил колесное шасси с носовой стойкой. Но ни одна из этих модификаций не успела стать боевой – было построено всего три экземпляра Me.163С и один Me.263 (после окончания войны переправленный в СССР и использовавшийся конструкторским бюро Микояна и Гуревича при создании опытного самолета И-270).
Работа немецких инженеров над ракетными самолетами этим не ограничилась. Применение подобных машин в первую очередь рассматривалось опробованным еще в годы Первой мировой войны методом «воздушного старта», при котором легкий истребитель – «паразит» доставлялся на высоту, необходимую для ведения действий, с помощью иного летательного аппарата.
У Мессершмитта в 1944 году разрабатывался проект ракетного истребителя Р.1104, который с выключенным двигателем должен был подниматься в воздух буксировщиком и использовать собственный ЖРД для атаки самолетов противника при их появлении в зоне видимости. Имеющий предельно простую конструкцию с максимальным использованием дерева, вооруженный одной 30-мм пушкой самолет согласно расчетам развивал бы скорость до 810 км/ч.
