Ночью они атаковали отряд Разина, после чего мятежники разошлись в разные стороны. Разин двинулся от Симбирска, прибыл в Самару, а затем в Саратов, но население городов не впустило его, и в феврале он появился на Дону у Черкасска. Войском была послана станица в Москву с просьбой о помощи. В московских церквах Разину прокричали «анафему», и на Дон был послан стольник с 1000 человек. Против повстанцев стали действовать отряды Барятинского, Долгорукова и других, очищавших от них страну. В Черкасск казаки не пустили Разина, он отошел и обосновался в Кагальнике.
14 апреля казаки выступили против Разина и подошли к Кагальнику. Лагерь Разина был укреплен и на валу стояли пушки. Когда же осаждавшие казаки пошли на приступ, то оказалось, что ни одна пушка не стреляет. Разин понял, что предан своими же. Он был взят и привезен в Черкасск, а весь отряд его уничтожен. Разин со своим братом Фролкой был под строгим конвоем отправлен в Москву, где после следствия его четвертовали. После казни Разина смута не окончилась. В Астрахани сидел Васька Ус и производил расправу с населением. Получив сведения о выдаче Разина, он отправил своего товарища, Шелудяка, к Симбирску. От Симбирска Шелудяк был отбит Шереметьевым и отошел в Самару, где после смерти Васьки Уса возглавил мятеж и пошел в Астрахань.
В конце августа к Астрахани подошел Милославский, и после переговоров Астрахань была открыта перед московскими войсками. Всем участникам мятежа была объявлена амнистия и отпущение вин, сначала даже Шелудяк был оставлен на воеводском дворе. Но летом 1672 года в Астрахань явился князь Одоевский для суда и расправы, и Шелудяк с зачинщиками были повешены.
Особым эпизодом мятежа Разина было восстание на Дальнем Севере в Соловецком монастыре. Монахи с архимандритом заперлись в монастыре и отказались иметь сношения с московскими властями, принявшими никоновскую церковную ересь. На вооружении монастыря было 99 пушек. Против них были посланы войска, которые и осадили монастырь. Осада продолжалась 7 лет, и только 23 декабря 1674 года из-за измены одного монаха, указавшего князю Мещерскому и его полку тайный проход в монастырской стене, крепость пала. Ночью стрельцы вошли на территорию монастыря. Архимандрит Никанор был казнен, другие мятежники разосланы в Кольский и Пустозерский остроги. Покаявшиеся были оставлены в живых.
Бунт Разина произошел после только что пережитой Москвой измены Выговского в Приднепровье. Измена эта дорого обошлась Москве, поэтому во время движения Разина Москва очень подозрительно смотрела на Донское войско. Войско Донское не приняло участия в движении Разина, но оставалось нейтральным и только в конце мятежа открыто выступило против него и ликвидировало мятеж. В Москве, однако, всех донских казаков называли «ворами и изменниками». В манифесте, обнародованном после мятежа, писалось: «Корнило Яковлев с товарищи, которые в том злом умысле были… донские казаки отбратились от зол своих» – и дальше обвинение смягчалось и писалось, что Разин «прямых старых казаков донских, которые за церковь и крестное целование и за Московское государство стояли с бояре и воеводы, их многих побил и пограбил и позорил…»
Тем не менее Москва решила укрепить свое положение на Дону и заставила атамана Корнила Яковлева в Москве присягнуть на службу царю, а на Дон был прислан стольник Косогов с стрельцами и требованием присяги войска. «Как будучи в Москве атаманы Корнило Яковлев и Михаиле Самаренинов, клялись великому государю из верных своих службах перед св. Евангелием обещались, также и вы казаки великому государю перед Евангелием веру учинили б».
