Серко начал действовать самостоятельно и рассылал универсалы, что Дорошенко отложился от султана и приложился к московскому царю. Москва требовала от Дорошенко, чтобы он принес присягу в присутствии Ромодановского и Самойловича. Дорошенко на свидание с Ромодановским не соглашался, но послал в Москву посольство и через него просил царя принять его под его высокую руку с условием жить на той стороне Днепра и иметь помощь против Крыма. Послов из Москвы отправили к Ромодановскому с приказанием, чтобы их задержали до приезда Дорошенко. Гетманом в Москве считался Самойлович, а Дорошенко был обещан Чигирин со всеми поселениями. 30 января 1676 года умер царь Алексей Михайлович.
Федор Алексеевич, старший сын Алексея Михайловича, вступил на престол 14-летним юношей. В центре московской политики была война с Турцией. Отношения с Турцией связывались с Польшей, юго-востоком и Поволжьем. Татары опустошали Волынь, Подолию и Галию. Польский король Ян Собесский не имел войска для защиты своих земель из-за неимения средств. Польша не могла одна противостоять Турции и просила помощи Москвы. На юго-востоке калмыки, признавшие власть московского царя, снова стали проявлять враждебные действия против русских границ. Приуральские киргизы также производили набеги на пограничные районы Москвы. Между донскими казаками и калмыками начались ссоры. Калмыки делали набеги на станицы донских казаков и забирали скот, уводя население в неволю.
Казаки отвечали тем же. В 1678 году состоявший на службе московского царя Теиша ездил к калмыкам и уговаривал их вождя Аюка и Тайшеи перейти на службу московского царя. Но Аюк заявил, что идти на службу царю не может из-за того, что донские и яицкие казаки побивают его людей, а жен и детей забирают. Царь приказал Каспулату помирить казаков с калмыками.
Претензии Турции и Крыма не ограничивались Украиной, – была еще надежда и на владения мусульманским юго-востоком. На пути присоединения юго-восточных мусульманских народов камнем преткновения стоял казачий Дон. В 1677 году султан Магомет IV требовал через своего посла в Москве изгнания казаков с Дона. Царь Федор Алексеевич на это требование ответил: «Казаков не выгоню, Азов возьму и все земли по Днестру постараюсь покорить».
Дон привлекал внимание Москвы еще тем, что по рекам Хопру и Медведице и в казачьих юртах стали скопляться «старцы и всякие приходящие люди, кои новые книги, церковную службу и иконное письмо хулят, образам божиим не поклоняются, многих людей из донских казаков к себе приговаривают и крестят в другой раз. Были посланы воеводы и стрелецкий голова для розыска, и было обнаружено, что на речке Черненькой живет поп Иов и с ним 20 чернецов, да беглецов до 30 человек. Из Москвы запросили, что это за пустыня и где находится река Чир? С Дона был ответ, что пустыня находится в стороне езды на день от городка Чир. В Войске знали, что живут там мужчины и женщины, ребята и девки, но без указа царя войско ничего сделать не может, а если государь прикажет разорить, то сейчас же будет разорено.
Кроме того, два года тому назад пришел на Дон и поселился в пустыне, в лесу, на крымской дороге, черный поп да два человека простых чернецов. Простые чернецы с попом поссорились, пришли в Черкасск и донесли войску, что поп «за великого государя Богу не молит и им молить не велит». Атаман Самаринов и все Войско послали за попом и, приведя в Черкасск, по войсковому праву попа сожгли, и в его пустыне теперь никто не живет.
Церковный раскол на Руси обострялся, и на Дон продолжали тянуться волны беглецов. По рекам и лесам старообрядцы устраивали пустынки, в них образовывали секстантские молельни, откуда разносили хулу на новые книги и церковные порядки. На границах Дона снова скапливались беглецы, как и во время Разина, но еще более фанатичные и непримиримые к московским порядкам.
На Украине Дорошенко с духовенством и в сопровождении 200 казаков, наконец, явился в стан Ромодановского и Самойловича, положил перед ними регалии, знамя и бунчук. Присяга Дорошенко на службу царя имела последствия на отношения с Польшей и Турцией. Когда московские представители объявили польскому королю о подданстве Дорошенко московскому царю, тому было неприятно, а паны заявили: «Вот вам и помощь и дружба царская! Он отобрал у нас всю Украину». Султан вместо Дорошенко объявил гетманом и князем украинским Юрия Хмельницкого. Он прислал в Запорожье грамоту, но она не подействовала. В августе к Чигирину подошли Ибрагим-паша с Хмельницким и ждали подхода хана. Туда же двигался Самойлович с 20 000 казаков и Ромодановский.
