Статья 87-я опубликованных в апреле 1906 г. Основных государственных законов предусматривала возможность издания императором законов во время прекращения заседаний Государственной думы, «если чрезвычайные обстоятельства вызовут необходимость в такой мере». 25 августа 1906 г. на основании этой статьи без санкции Государственной думы были введены военно-полевые суды, отличавшиеся от обычных упрощенным судопроизводством и ускоренной процедурой приведения приговора в исполнение. До конца 1906 г. по приговору военно-полевых судов было казнено 683 человека, в основном за террористическую деятельность. Справедливости ради нужно отметить, что за этот же срок революционеры убили 768 и ранили 820 представителей государственной власти.
Выборы во вторую Государственную думу в феврале 1907 г. вновь продемонстрировали правительству, что существующий избирательный закон не позволяет сформировать если не проправительственный, то хотя бы умеренный центристский законодательный орган. Из 518 депутатов Думы второго созыва 223 принадлежали к крайне левым (социал-демократы, эсеры, народные социалисты, трудовики), умеренно левых кадетов насчитывалось 99, национальные окраины представляли около 100 депутатов, которые в большинстве своем тоже были антиправительственно настроены. Лишь 54 места имели правые центристы (октябристы) и крайне правые.
Государственная дума второго созыва продолжала линию первой Думы в аграрном вопросе. Декларативно выдвигая самые радикальные требования в пользу крестьян, она в тоже время отклонила в целом прогрессивный закон о праве выхода крестьян из сельской общины. Попытки правительства достичь компромисса воспринимались неконструктивно. 6 марта 1907 г. Столыпин, выступая в Думе, произнес свою знаменитую фразу: «Им нужны великие потрясения, нам нужна великая Россия!».
Конец существованию второй Думы положил конфликт по делу о депутатах социал-демократической фракции, изобличенных в проведении революционной работы в армии. Правительство потребовало лишить этих депутатов парламентской неприкосновенности, но Дума пошла по пути затягивания процедуры. Перед властью встала дилемма: либо распустить Думу и в порядке действия 87-й статьи ввести новый избирательный закон, либо упразднить Думу вообще и установить диктатуру. Император и правительство выбрали умеренный первый вариант.
3 июня 1907 г. были одновременно опубликованы высочайший манифест о роспуске Думы и новый избирательный закон, установивший преимущество землевладельцев перед другими куриями избирателей и ограничивший представительство национальных окраин. Поскольку закон был введен на основании статьи 87-й без одобрения Думы, оппозиция назвала акты 3 июня «государственным переворотом». Таким образом, 3 июня 1907 г. можно считать окончанием первой русской революции и установлением думской монархии, которая отличалась от прежней неограниченной самодержавной монархии наличием самостоятельного органа законодательной власти – двухпалатного парламента, состоящего из Государственной думы (нижняя палата) и Государственного совета (верхняя палата). Государственная дума избиралась на пятилетний срок. Избирательное право было всеобщим и прямым в Санкт-Петербурге, Москве и крупных городах, двух и трехступенчатым в губерниях. Государственный совет формировался наполовину из лиц, назначаемых императором, и наполовину из выборных от духовенства, земских собраний, дворянских собраний, академий и университетов, землевладельцев Царства Польского и неземских губерний. Законодательно были закреплены гражданские свободы – вероисповедания, печати, собраний и союзов и ряд других.
Революция 1905–1907 гг. не носила четко выраженного классового характера. В революционном движении принимали участие не только рабочие и крестьяне. Оппозиционной и даже антиправительственной деятельностью занимались и представители родовой аристократии (князья Долгоруковы, Трубецкие, Голицыны и др.), и крупные промышленники и фабриканты (Морозов, Терещенко, Четвериков и др.). В то же время представители пролетариата и крестьянства принимали широкое участие в монархических и крайне правых организациях. Со стороны трудящихся слоев имело место и стихийное сопротивление революции. Например, в июле 1905 г. в Нижнем Новгороде революционная манифестация была без подстрекательства властей разогнана портовыми рабочими. В Балашове Саратовской губернии, где проходили серьезные крестьянские выступления, толпа едва не растерзала представителей оппозиции, и они спаслись от расправы лишь благодаря вмешательству губернатора П. А. Столыпина. В Москве в октябре 1905 г. происходили стычки революционеров с рабочими-монархистами. Дело дошло до кровопролития, и один из революционных активистов Н. Э. Бауман был убит мастеровым Михалиным. Аналогичные случаи имели место в Киеве, Одессе, Нежине, Томске, Саратове, Самаре, Баку, Эривани и других городах. Всё это говорит о неоднозначности и противоречивости революционного процесса, охватившего Россию в начале XX в.
