Тем же Федеральным законом от 25 июня 1998 г. был устранен имевшийся пробел в УК, касавшийся порядка назначения наказания (ст. 69), если совокупность составляли преступление небольшой тяжести и преступление средней тяжести, тяжкое и особо тяжкое.
Часть 4 ст. 15 УК (в ред. 1996 г.) к тяжким преступлениям относила и неосторожные преступления, за совершение которых предусматривалось наказание на срок свыше пяти лет лишения свободы. Федеральным законом от 14 марта 2001 г. все неосторожные преступления, наказуемые лишением свободы на срок свыше двух лет, отнесены к категории преступлений средней тяжести.
Законодатель несколько раз возвращался к норме Уголовного кодекса о необходимой обороне (ст. 37). В целях большей гарантии прав граждан на необходимую оборону и исключения случаев необоснованного осуждения за превышение пределов необходимой обороны, которого фактически не было, Федеральный закон от 14 марта 2002 г. установил, что если общественно опасное посягательство было сопряжено с насилием опасным для жизни обороняющегося или другого лица, либо с непосредственной угрозой применения такого насилия, то правомерным следует считать причинение нападающему любого вреда. Эта новелла была неоднозначно и в целом критически встречена юридической общественностью. Вопреки намерениям разработчиков этого Закона, она не только не расширяла право обороняющегося на защиту, но, напротив, поставила обороняющегося в сложное положение, поскольку обязывала его всякий раз тщательно определять, было ли нападение опасным для жизни. В связи с этим возникают резонные вопросы: правомерными ли будут с точки зрения закона действия обороняющегося, который убил преступника, пытавшегося причинить тяжкий вред здоровью (лишить органа зрения, слуха, насильственно прервать беременность и т. д.), совершить изнасилование, осуществить захват заложника и т. п., когда непосредственной опасности для жизни оборонявшегося и других лиц не создавалось? Федеральным законом от 8 декабря 2003 г. ст. 37 УК была дополнена частью 2–1, согласно которой не являются превышением пределов необходимой обороны действия обороняющегося лица, если это лицо вследствие неожиданности посягательства не могло объективно оценить степень и характер опасности нападения.